More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4266 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4266  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1091 aa  2227    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4280  TonB-dependent receptor plug  35.04 
 
 		 1144 aa  618  1e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4279  TonB-dependent receptor plug  34.15 
 
 		 1153 aa  578  1.0000000000000001e-163  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4278  TonB-dependent receptor plug  34.94 
 
 		 1146 aa  574  1.0000000000000001e-162  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4287  TonB-dependent receptor plug  32.28 
 
 		 1149 aa  521  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3766  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 1146 aa  327  6e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2317  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 1202 aa  306  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1349  TonB-dependent receptor plug  45.33 
 
 		 1232 aa  233  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2928  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 		 1245 aa  186  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2495  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1247 aa  177  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2901  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 1134 aa  173  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.269795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3377  TonB-dependent receptor plug  36.86 
 
 		 1314 aa  166  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615766  normal  0.66786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1755  TonB-dependent receptor plug  38.98 
 
 		 1289 aa  166  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1794  TonB-dependent receptor plug  37.29 
 
 		 1302 aa  161  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0596  TonB-dependent receptor plug  34.31 
 
 		 1245 aa  157  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0600  TonB-dependent receptor plug  35.62 
 
 		 1294 aa  151  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1991  TonB-dependent receptor plug  36.1 
 
 		 1243 aa  151  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302175  normal  0.112109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1013  TonB-dependent receptor plug  34.62 
 
 		 1273 aa  149  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1754  TonB-dependent receptor plug  37.24 
 
 		 1243 aa  148  7.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3234  TonB-dependent receptor plug  31.46 
 
 		 1221 aa  142  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763048  normal  0.0174911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2048  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 929 aa  141  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.221244  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3199  TonB-dependent receptor plug  32.98 
 
 		 1297 aa  130  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1286  TonB-dependent receptor plug  28.27 
 
 		 978 aa  107  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1267  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 980 aa  102  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1125  TonB-dependent receptor plug  27.76 
 
 		 967 aa  95.1  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304926 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0522  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 817 aa  78.2  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  27.07 
 
 		 721 aa  72  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.93 
 
 		 833 aa  71.2  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  26.32 
 
 		 801 aa  69.7  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4135  ferrioxamine B receptor precursor protein  26.67 
 
 		 726 aa  69.7  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156472  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  31.2 
 
 		 708 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 727 aa  68.2  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  24.35 
 
 		 701 aa  67.4  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  30.04 
 
 		 709 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  29.72 
 
 		 741 aa  67  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  27.76 
 
 		 745 aa  67  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 736 aa  67  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  28.14 
 
 		 753 aa  67  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  29.72 
 
 		 752 aa  67  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 736 aa  67  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  28.14 
 
 		 753 aa  67  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  28.37 
 
 		 737 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 738 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  26.17 
 
 		 745 aa  65.9  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  27.83 
 
 		 755 aa  65.5  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  31.61 
 
 		 711 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 		 734 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  28.96 
 
 		 715 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 		 736 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 712 aa  63.5  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  26.54 
 
 		 708 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 		 708 aa  63.5  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1281  TonB-dependent siderophore receptor  30.16 
 
 		 699 aa  62.8  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  28.66 
 
 		 735 aa  63.2  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  25 
 
 		 747 aa  63.2  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  26.54 
 
 		 703 aa  62.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1676  TonB-dependent siderophore receptor  26.14 
 
 		 757 aa  62.4  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  25.61 
 
 		 789 aa  62.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  25.71 
 
 		 735 aa  62.8  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 776 aa  62.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 		 694 aa  62.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 		 815 aa  62.4  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  31.55 
 
 		 734 aa  62.4  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3417  TonB dependent outer membrane ferrichrome-iron receptor  26.79 
 
 		 715 aa  62  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  28.5 
 
 		 745 aa  62  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 		 812 aa  62  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2131  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 757 aa  60.8  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0772564  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 		 701 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 		 814 aa  60.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 727 aa  60.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  29.12 
 
 		 732 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  28.29 
 
 		 732 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  25 
 
 		 752 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  29.49 
 
 		 710 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  27.47 
 
 		 713 aa  60.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 		 734 aa  59.3  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  26.34 
 
 		 806 aa  59.3  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 780 aa  59.3  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  28.74 
 
 		 736 aa  59.3  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 		 770 aa  58.9  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  28.28 
 
 		 797 aa  58.5  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  26.55 
 
 		 708 aa  58.5  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1440  TonB dependent, hydroxamate-type ferrisiderophore, outer membrane receptor  27.24 
 
 		 699 aa  58.5  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453975  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  24.11 
 
 		 709 aa  58.5  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1562  TonB-dependent siderophore receptor  28.46 
 
 		 753 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000416689  normal  0.182143 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 794 aa  58.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4099  TonB-dependent siderophore receptor  30.85 
 
 		 743 aa  58.5  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0727583  decreased coverage  0.00321586 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  23.59 
 
 		 747 aa  58.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0089  TonB-dependent siderophore receptor  27.24 
 
 		 699 aa  58.2  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.26085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  29.44 
 
 		 860 aa  58.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  27.85 
 
 		 713 aa  58.2  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 792 aa  58.2  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 742 aa  58.2  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  29.39 
 
 		 710 aa  58.2  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  25.89 
 
 		 797 aa  58.2  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  24.79 
 
 		 815 aa  58.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  24.88 
 
 		 703 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3062  TonB-dependent siderophore receptor  26.07 
 
 		 715 aa  57.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.173013 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1912  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 969 aa  57.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 		 723 aa  57.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>