More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2928 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3766  TonB-dependent receptor plug  37.64 
 
 		 1146 aa  694    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2928  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1245 aa  2533    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2317  TonB-dependent receptor plug  32.59 
 
 		 1202 aa  503  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0596  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 		 1245 aa  460  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1991  TonB-dependent receptor plug  30.66 
 
 		 1243 aa  459  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302175  normal  0.112109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0600  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 1294 aa  428  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1754  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 		 1243 aa  416  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3377  TonB-dependent receptor plug  34.2 
 
 		 1314 aa  271  7e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615766  normal  0.66786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3199  TonB-dependent receptor plug  32.13 
 
 		 1297 aa  261  8e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3234  TonB-dependent receptor plug  28.49 
 
 		 1221 aa  239  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763048  normal  0.0174911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1794  TonB-dependent receptor plug  46.46 
 
 		 1302 aa  235  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1755  TonB-dependent receptor plug  45.9 
 
 		 1289 aa  232  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2495  TonB-dependent receptor plug  42.62 
 
 		 1247 aa  227  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1013  TonB-dependent receptor plug  46.55 
 
 		 1273 aa  224  8e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2901  TonB-dependent receptor plug  40.68 
 
 		 1134 aa  198  6e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.269795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4280  TonB-dependent receptor plug  24.22 
 
 		 1144 aa  194  6e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4279  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 		 1153 aa  164  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4278  TonB-dependent receptor plug  24.19 
 
 		 1146 aa  162  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2048  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 929 aa  160  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.221244  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1349  TonB-dependent receptor plug  34.2 
 
 		 1232 aa  149  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4266  TonB-dependent receptor plug  35.82 
 
 		 1091 aa  136  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4287  TonB-dependent receptor plug  32.45 
 
 		 1149 aa  135  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1286  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 978 aa  126  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1267  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 980 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0522  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 817 aa  94.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  30.73 
 
 		 727 aa  87  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1125  TonB-dependent receptor plug  26.16 
 
 		 967 aa  85.5  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304926 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3560  TonB-dependent siderophore receptor  31.34 
 
 		 710 aa  80.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 694 aa  80.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  29.85 
 
 		 715 aa  79.7  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3521  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 699 aa  80.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  24.55 
 
 		 701 aa  78.6  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  32.42 
 
 		 735 aa  75.9  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2131  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 757 aa  74.7  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0772564  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 719 aa  74.3  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 794 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 692 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  31.75 
 
 		 733 aa  74.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  28.5 
 
 		 831 aa  74.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 		 745 aa  73.2  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  28.44 
 
 		 696 aa  72.8  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.5 
 
 		 703 aa  72.4  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 		 797 aa  72  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  27.17 
 
 		 719 aa  72  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1352  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 832 aa  72  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 829 aa  72  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.17 
 
 		 833 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 708 aa  71.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 820 aa  71.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 863 aa  70.1  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  29.79 
 
 		 701 aa  70.5  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  23.62 
 
 		 735 aa  70.5  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  27.04 
 
 		 703 aa  69.7  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0947  TonB-dependent siderophore receptor  29.77 
 
 		 683 aa  69.7  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0779656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  25.55 
 
 		 728 aa  69.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  26.74 
 
 		 707 aa  68.9  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  24.69 
 
 		 705 aa  68.6  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 		 862 aa  68.6  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  28.94 
 
 		 708 aa  68.2  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  27.37 
 
 		 794 aa  68.6  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  24.17 
 
 		 779 aa  68.2  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  28.19 
 
 		 709 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  26.25 
 
 		 828 aa  68.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 		 814 aa  67.8  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  26.41 
 
 		 840 aa  67.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3277  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 702 aa  67.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.85101  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2977  TonB-dependent receptor, plug  24.02 
 
 		 518 aa  67  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826241  normal  0.256941 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3929  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 702 aa  67.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  22.95 
 
 		 737 aa  66.2  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  25.71 
 
 		 828 aa  66.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0683  TonB-dependent siderophore receptor  27.67 
 
 		 728 aa  66.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4099  TonB-dependent siderophore receptor  30.65 
 
 		 743 aa  65.9  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0727583  decreased coverage  0.00321586 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  25.71 
 
 		 828 aa  65.9  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  28.08 
 
 		 747 aa  65.9  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 721 aa  65.9  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  28.08 
 
 		 747 aa  65.9  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 711 aa  65.9  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0672  TonB-dependent siderophore receptor  27.67 
 
 		 728 aa  65.9  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264811  normal  0.669281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  26.59 
 
 		 701 aa  65.9  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 714 aa  65.5  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5955  TonB-dependent siderophore receptor  28.81 
 
 		 877 aa  65.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0124539 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  29.36 
 
 		 722 aa  65.5  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3716  TonB-dependent receptor, plug  27.85 
 
 		 527 aa  65.1  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0878035  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  27.91 
 
 		 720 aa  65.1  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  24.88 
 
 		 744 aa  64.7  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  28.08 
 
 		 747 aa  64.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  28.29 
 
 		 799 aa  64.3  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003567  ferrichrome-iron receptor  28.12 
 
 		 740 aa  64.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  27.09 
 
 		 747 aa  64.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  25.75 
 
 		 708 aa  64.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 755 aa  64.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  28.08 
 
 		 745 aa  64.7  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  26.34 
 
 		 724 aa  64.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  26.34 
 
 		 724 aa  64.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  24.88 
 
 		 744 aa  64.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3331  TonB-dependent siderophore receptor  23.83 
 
 		 766 aa  63.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153274  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3640  TonB-dependent siderophore receptor  23.75 
 
 		 708 aa  63.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168279  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  27.09 
 
 		 747 aa  63.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1912  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 969 aa  63.5  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  23.47 
 
 		 733 aa  63.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>