More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1267 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1286  TonB-dependent receptor plug  43.22 
 
 		 978 aa  718    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1267  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 980 aa  2013    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  23.06 
 
 		 703 aa  127  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2317  TonB-dependent receptor plug  32.65 
 
 		 1202 aa  125  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2495  TonB-dependent receptor plug  32.33 
 
 		 1247 aa  120  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2928  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 		 1245 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  29.79 
 
 		 862 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3766  TonB-dependent receptor plug  31.93 
 
 		 1146 aa  115  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282602  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.98 
 
 		 703 aa  114  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  31.62 
 
 		 843 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  37.33 
 
 		 859 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 703 aa  112  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0522  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 817 aa  112  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  29.64 
 
 		 708 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2048  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 929 aa  108  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.221244  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  27.45 
 
 		 701 aa  108  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  31.36 
 
 		 741 aa  107  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 		 709 aa  107  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0596  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 1245 aa  106  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  32.95 
 
 		 850 aa  107  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  28.78 
 
 		 794 aa  107  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 		 696 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.43 
 
 		 696 aa  106  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  30.57 
 
 		 706 aa  105  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3377  TonB-dependent receptor plug  32.66 
 
 		 1314 aa  103  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615766  normal  0.66786 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  29.71 
 
 		 715 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1794  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1302 aa  103  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5955  TonB-dependent siderophore receptor  28.78 
 
 		 877 aa  103  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0124539 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  25.44 
 
 		 692 aa  102  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  28.28 
 
 		 743 aa  102  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  24.46 
 
 		 825 aa  102  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  28.08 
 
 		 726 aa  102  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  31.76 
 
 		 817 aa  102  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  28.16 
 
 		 722 aa  101  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  27.87 
 
 		 745 aa  101  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  27.1 
 
 		 825 aa  101  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  29.37 
 
 		 864 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3640  TonB-dependent siderophore receptor  23.63 
 
 		 708 aa  100  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168279  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  30.74 
 
 		 727 aa  100  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 		 726 aa  100  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1013  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 1273 aa  99.8  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 		 730 aa  100  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 860 aa  99.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  30.8 
 
 		 719 aa  99  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 		 701 aa  99  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2192  ferrioxamine B receptor precursor protein  29.11 
 
 		 724 aa  98.6  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  decreased coverage  0.00773577 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.04 
 
 		 713 aa  98.6  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2901  TonB-dependent receptor plug  36.41 
 
 		 1134 aa  98.6  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.269795  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.91 
 
 		 833 aa  97.8  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2875  outer membrane protein  27.86 
 
 		 733 aa  97.1  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.917114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 		 736 aa  96.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  29.66 
 
 		 689 aa  96.3  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  23.3 
 
 		 732 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 733 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  25.74 
 
 		 710 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  30.97 
 
 		 792 aa  95.5  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  28.48 
 
 		 733 aa  95.9  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  26.2 
 
 		 708 aa  95.1  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  28.39 
 
 		 734 aa  94  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  24.49 
 
 		 720 aa  94.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 829 aa  94  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1754  TonB-dependent receptor plug  33.67 
 
 		 1243 aa  94.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  27.34 
 
 		 808 aa  92.8  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  29.37 
 
 		 715 aa  91.7  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 828 aa  91.3  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0672  TonB-dependent siderophore receptor  29.09 
 
 		 728 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264811  normal  0.669281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0683  TonB-dependent siderophore receptor  29.15 
 
 		 728 aa  90.9  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3560  TonB-dependent siderophore receptor  28.5 
 
 		 710 aa  90.9  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0600  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 1294 aa  90.5  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3234  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 1221 aa  89.7  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763048  normal  0.0174911 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  28.81 
 
 		 714 aa  90.1  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  22.75 
 
 		 797 aa  90.5  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  29.21 
 
 		 694 aa  89.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1281  TonB-dependent siderophore receptor  25.6 
 
 		 699 aa  90.1  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3521  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 		 699 aa  90.1  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1755  TonB-dependent receptor plug  31.19 
 
 		 1289 aa  89.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  27.87 
 
 		 719 aa  89.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  29.66 
 
 		 738 aa  89.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  27.53 
 
 		 799 aa  89  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  22.56 
 
 		 721 aa  89  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.27 
 
 		 711 aa  88.6  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  27.5 
 
 		 710 aa  88.6  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0947  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 		 683 aa  88.6  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0779656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 		 689 aa  88.6  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 723 aa  88.2  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  26.25 
 
 		 831 aa  88.6  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1991  TonB-dependent receptor plug  32.88 
 
 		 1243 aa  88.2  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302175  normal  0.112109 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  27.33 
 
 		 727 aa  87.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 		 771 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  28.32 
 
 		 713 aa  87  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  29.41 
 
 		 829 aa  87.8  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4135  ferrioxamine B receptor precursor protein  25.86 
 
 		 726 aa  87.4  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156472  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  25.91 
 
 		 863 aa  87.8  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  27.97 
 
 		 822 aa  87  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1349  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 1232 aa  86.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  25.68 
 
 		 708 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  21.33 
 
 		 821 aa  85.9  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  27.41 
 
 		 718 aa  86.3  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0338  ferrioxamine B receptor precursor protein  25.78 
 
 		 705 aa  85.5  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.203857  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  23.63 
 
 		 724 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>