283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3234 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0596  TonB-dependent receptor plug  40.16 
 
 		 1245 aa  800    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1013  TonB-dependent receptor plug  37.4 
 
 		 1273 aa  650    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1991  TonB-dependent receptor plug  40.28 
 
 		 1243 aa  803    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302175  normal  0.112109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3234  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1221 aa  2500    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763048  normal  0.0174911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0600  TonB-dependent receptor plug  38.13 
 
 		 1294 aa  749    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3199  TonB-dependent receptor plug  36.81 
 
 		 1297 aa  704    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2495  TonB-dependent receptor plug  33.28 
 
 		 1247 aa  540  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1794  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 1302 aa  488  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3766  TonB-dependent receptor plug  31.89 
 
 		 1146 aa  469  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2317  TonB-dependent receptor plug  30.11 
 
 		 1202 aa  455  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1754  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1243 aa  380  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1755  TonB-dependent receptor plug  32.84 
 
 		 1289 aa  371  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3377  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1314 aa  282  3e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615766  normal  0.66786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2928  TonB-dependent receptor plug  28.49 
 
 		 1245 aa  239  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4287  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 1149 aa  215  4.9999999999999996e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2901  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 		 1134 aa  214  7.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.269795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2048  TonB-dependent receptor  37.12 
 
 		 929 aa  162  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.221244  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1349  TonB-dependent receptor plug  32.74 
 
 		 1232 aa  160  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4278  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 1146 aa  154  8e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4279  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 		 1153 aa  149  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4280  TonB-dependent receptor plug  33.22 
 
 		 1144 aa  146  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4266  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 		 1091 aa  118  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1267  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 980 aa  102  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1286  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 978 aa  95.5  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  28.19 
 
 		 703 aa  72.8  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1125  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 967 aa  71.6  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304926 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  25.09 
 
 		 701 aa  71.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  25.09 
 
 		 701 aa  71.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  25.09 
 
 		 701 aa  71.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2131  TonB-dependent receptor plug  28.8 
 
 		 757 aa  67  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0772564  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  23.66 
 
 		 701 aa  65.1  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 732 aa  65.1  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  23.66 
 
 		 701 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  30.72 
 
 		 776 aa  63.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1352  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 832 aa  63.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  27.98 
 
 		 715 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  25.5 
 
 		 692 aa  62.8  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 732 aa  62.4  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  27.82 
 
 		 749 aa  62.4  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 727 aa  62  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  28.16 
 
 		 694 aa  62  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 		 862 aa  62  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 734 aa  62  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 736 aa  61.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 		 730 aa  61.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  21.71 
 
 		 701 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 734 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  27.82 
 
 		 712 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  28.81 
 
 		 723 aa  60.1  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  25.97 
 
 		 731 aa  60.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 689 aa  60.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  26.37 
 
 		 743 aa  59.7  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  25.11 
 
 		 730 aa  60.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  24.68 
 
 		 731 aa  60.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  25.11 
 
 		 730 aa  60.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  26.14 
 
 		 732 aa  60.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 		 730 aa  59.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3914  TonB-dependent receptor, putative  26.37 
 
 		 730 aa  59.3  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  26.14 
 
 		 714 aa  59.3  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  25.49 
 
 		 734 aa  59.3  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  25.83 
 
 		 710 aa  59.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 745 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1562  TonB-dependent siderophore receptor  25.45 
 
 		 753 aa  59.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000416689  normal  0.182143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  26.84 
 
 		 719 aa  58.9  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1164  TonB-dependent siderophore receptor  26.07 
 
 		 754 aa  59.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0408687  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1619  TonB-dependent siderophore receptor  26.07 
 
 		 754 aa  59.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285071 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1644  TonB-dependent siderophore receptor  26.07 
 
 		 754 aa  59.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107171  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0522  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 817 aa  58.9  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 722 aa  58.5  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  25.27 
 
 		 731 aa  58.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 766 aa  58.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 		 753 aa  58.2  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  25.6 
 
 		 710 aa  58.2  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 770 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  24.73 
 
 		 755 aa  57.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1655  TonB-dependent siderophore receptor  33.82 
 
 		 656 aa  57.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4786  TonB-dependent siderophore receptor  40.58 
 
 		 712 aa  58.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.789588  normal  0.608467 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 		 745 aa  57.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  25.24 
 
 		 701 aa  57.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3560  TonB-dependent siderophore receptor  32.21 
 
 		 710 aa  57.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  24.1 
 
 		 737 aa  57.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  26.89 
 
 		 724 aa  57  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0238  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 777 aa  56.6  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0584339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4790  TonB-dependent siderophore receptor  24.51 
 
 		 750 aa  56.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  24.34 
 
 		 741 aa  55.8  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  24.34 
 
 		 753 aa  56.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  24.34 
 
 		 736 aa  55.8  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  24.34 
 
 		 736 aa  55.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  24.34 
 
 		 752 aa  56.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  24.34 
 
 		 753 aa  56.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 		 719 aa  55.8  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  25.73 
 
 		 736 aa  55.8  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  27.52 
 
 		 733 aa  55.8  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  25.86 
 
 		 708 aa  55.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  30.54 
 
 		 735 aa  55.8  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1078  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 748 aa  55.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  27.73 
 
 		 710 aa  55.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 		 701 aa  55.1  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1440  TonB dependent, hydroxamate-type ferrisiderophore, outer membrane receptor  26.64 
 
 		 699 aa  55.1  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453975  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0089  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 		 699 aa  55.5  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.26085  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>