More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2131 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2131  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 757 aa  1545    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0772564  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1352  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 832 aa  299  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3722  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 896 aa  255  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.275954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3723  TonB-dependent receptor plug  30.75 
 
 		 767 aa  238  4e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3505  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 830 aa  156  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  24.87 
 
 		 692 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  23.2 
 
 		 701 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4489  TonB-dependent siderophore receptor  24.07 
 
 		 785 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  23.74 
 
 		 740 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4121  TonB-dependent siderophore receptor  24.07 
 
 		 785 aa  115  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.922703 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  22.78 
 
 		 703 aa  114  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  24.36 
 
 		 714 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  23.98 
 
 		 714 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  24.71 
 
 		 707 aa  112  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  23.39 
 
 		 748 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  23.39 
 
 		 748 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  23.98 
 
 		 677 aa  112  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  23.46 
 
 		 749 aa  111  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  22.74 
 
 		 738 aa  110  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  23.28 
 
 		 709 aa  109  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  23.02 
 
 		 809 aa  108  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  23.28 
 
 		 723 aa  107  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  24.75 
 
 		 797 aa  107  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4602  TonB-dependent siderophore receptor  23.98 
 
 		 784 aa  106  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  24.6 
 
 		 863 aa  106  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  22.96 
 
 		 737 aa  105  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  24.44 
 
 		 855 aa  104  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  24.44 
 
 		 855 aa  104  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  23.5 
 
 		 701 aa  103  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  24.28 
 
 		 815 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4761  TonB-dependent siderophore receptor  24.86 
 
 		 797 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  24.72 
 
 		 858 aa  103  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  22.58 
 
 		 724 aa  103  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4755  TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 		 797 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.251254  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4624  TonB-dependent siderophore receptor  25.34 
 
 		 797 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185618  decreased coverage  0.0000000123032 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  24.41 
 
 		 795 aa  102  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2414  TonB-dependent siderophore receptor  22.77 
 
 		 737 aa  102  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486485  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  22.5 
 
 		 724 aa  102  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  24.45 
 
 		 850 aa  100  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  24.45 
 
 		 796 aa  100  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  24.77 
 
 		 713 aa  99  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  24.46 
 
 		 796 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  21.59 
 
 		 742 aa  98.6  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1841  TonB-dependent siderophore receptor  22.82 
 
 		 696 aa  97.8  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000240616  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  24.63 
 
 		 713 aa  97.8  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  21.64 
 
 		 742 aa  97.8  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  22.99 
 
 		 714 aa  97.4  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  22.64 
 
 		 720 aa  97.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  22.77 
 
 		 720 aa  97.1  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3412  ferrichrome iron receptor  22.33 
 
 		 691 aa  97.1  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000883951  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  24.31 
 
 		 796 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1617  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  23.21 
 
 		 728 aa  95.9  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000544721  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  22.56 
 
 		 706 aa  94.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  21.92 
 
 		 810 aa  94.4  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  22.67 
 
 		 815 aa  94  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  23.07 
 
 		 814 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  22.51 
 
 		 720 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  23.41 
 
 		 757 aa  94  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  23.82 
 
 		 711 aa  94  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  22.31 
 
 		 689 aa  92  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  23.59 
 
 		 705 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  22.55 
 
 		 701 aa  92  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  24.77 
 
 		 724 aa  91.7  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  24.01 
 
 		 796 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3640  TonB-dependent siderophore receptor  24.61 
 
 		 708 aa  90.5  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168279  normal  0.0985281 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  23.58 
 
 		 729 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  22.04 
 
 		 701 aa  89.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  23.98 
 
 		 786 aa  89.7  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  23.36 
 
 		 709 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  23.17 
 
 		 701 aa  89.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1013  TonB-dependent receptor plug  32.42 
 
 		 1273 aa  89.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530732 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  23.91 
 
 		 740 aa  89.4  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  29.91 
 
 		 706 aa  88.6  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003567  ferrichrome-iron receptor  30.74 
 
 		 740 aa  88.6  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  24.25 
 
 		 821 aa  88.6  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  29.91 
 
 		 706 aa  88.6  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  31.34 
 
 		 719 aa  87.8  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  23.71 
 
 		 729 aa  87.4  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  23.71 
 
 		 729 aa  87.4  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  22.17 
 
 		 701 aa  87.4  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  27.05 
 
 		 797 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  22.92 
 
 		 726 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  22.61 
 
 		 698 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  23.79 
 
 		 794 aa  87  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  23.45 
 
 		 729 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  23.45 
 
 		 729 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  23.71 
 
 		 729 aa  85.9  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  23.45 
 
 		 729 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  24.77 
 
 		 731 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  24.17 
 
 		 731 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  23.45 
 
 		 729 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  23.23 
 
 		 810 aa  86.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  24.17 
 
 		 731 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  22.64 
 
 		 860 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  24.03 
 
 		 778 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1006  TonB-dependent siderophore receptor  33.04 
 
 		 726 aa  85.9  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  22.87 
 
 		 721 aa  85.5  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  23.5 
 
 		 729 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3521  TonB-dependent siderophore receptor  23.43 
 
 		 699 aa  85.1  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 825 aa  85.1  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>