More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1352 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1352  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 832 aa  1704    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2131  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 757 aa  291  3e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0772564  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3723  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 767 aa  200  7e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3722  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 896 aa  194  6e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.275954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3505  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 830 aa  145  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  35.07 
 
 		 694 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  32.97 
 
 		 715 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  30.74 
 
 		 707 aa  112  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  23.42 
 
 		 740 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  23.25 
 
 		 749 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  22.89 
 
 		 748 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  22.89 
 
 		 748 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  22.37 
 
 		 738 aa  105  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  22.29 
 
 		 737 aa  101  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1006  TonB-dependent siderophore receptor  32.4 
 
 		 726 aa  101  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  22.73 
 
 		 711 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 		 709 aa  100  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  21.58 
 
 		 742 aa  100  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30 
 
 		 703 aa  99.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  21.65 
 
 		 742 aa  99  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  27.13 
 
 		 708 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  29.73 
 
 		 701 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  26.91 
 
 		 703 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 779 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.76 
 
 		 696 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  29.49 
 
 		 703 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  27.85 
 
 		 719 aa  93.6  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  28.1 
 
 		 743 aa  93.2  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  22.48 
 
 		 708 aa  92  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  28.29 
 
 		 696 aa  91.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  29.91 
 
 		 726 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3412  ferrichrome iron receptor  25.78 
 
 		 691 aa  89.4  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000883951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  29.38 
 
 		 706 aa  89  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  29.38 
 
 		 706 aa  89  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3331  TonB-dependent siderophore receptor  27.16 
 
 		 766 aa  89.4  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153274  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  26.98 
 
 		 692 aa  89  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 837 aa  88.6  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  29.57 
 
 		 695 aa  88.6  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1286  TonB-dependent receptor plug  23.98 
 
 		 978 aa  88.6  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  27.71 
 
 		 730 aa  88.2  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  29.44 
 
 		 726 aa  88.2  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  28.98 
 
 		 824 aa  87.8  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  31.02 
 
 		 740 aa  87.8  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 		 731 aa  87.8  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  22.49 
 
 		 767 aa  87  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 		 726 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 820 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  29.63 
 
 		 757 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  29.63 
 
 		 709 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 794 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  24.82 
 
 		 733 aa  84.3  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 		 723 aa  82.8  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  24.69 
 
 		 814 aa  82.8  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  25.16 
 
 		 812 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0311  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 697 aa  82.8  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000107098  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2554  TonB-dependent siderophore receptor  21.62 
 
 		 776 aa  82  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  21.89 
 
 		 728 aa  82  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  24.82 
 
 		 755 aa  81.6  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0522  TonB-dependent receptor  21.72 
 
 		 817 aa  81.3  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  24.81 
 
 		 828 aa  81.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  26.74 
 
 		 754 aa  80.9  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  25.07 
 
 		 708 aa  80.9  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 706 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2580  iron(III) compound receptor  29.17 
 
 		 718 aa  80.9  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000113666  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  24.91 
 
 		 710 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  28.3 
 
 		 713 aa  80.1  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  26.04 
 
 		 730 aa  80.9  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  25.6 
 
 		 710 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 		 723 aa  80.1  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  25.08 
 
 		 729 aa  80.1  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003567  ferrichrome-iron receptor  26.67 
 
 		 740 aa  79.7  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  22.14 
 
 		 803 aa  79  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  28.26 
 
 		 710 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  27.69 
 
 		 815 aa  78.6  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 794 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  24.6 
 
 		 725 aa  79  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 770 aa  78.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  31.98 
 
 		 705 aa  78.6  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  28.81 
 
 		 710 aa  78.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1152  TonB-dependent siderophore receptor  26.48 
 
 		 790 aa  78.6  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  23.81 
 
 		 717 aa  78.6  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  25.91 
 
 		 815 aa  78.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  23.81 
 
 		 717 aa  78.2  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1267  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 980 aa  77.8  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  25.35 
 
 		 747 aa  77.8  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  26.06 
 
 		 703 aa  77.8  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  26.06 
 
 		 703 aa  77.8  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 792 aa  77.4  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  26.83 
 
 		 808 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2928  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 1245 aa  77  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  23.95 
 
 		 729 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.54 
 
 		 711 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  22.99 
 
 		 799 aa  76.6  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  22.34 
 
 		 806 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1049  TonB-dependent siderophore receptor  27.86 
 
 		 788 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  25.61 
 
 		 733 aa  76.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 795 aa  76.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  23.24 
 
 		 799 aa  76.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1948  TonB-dependent receptor plug  26.2 
 
 		 815 aa  75.9  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  26.4 
 
 		 741 aa  75.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>