More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3722 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3723  TonB-dependent receptor plug  65.86 
 
 		 767 aa  987    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3722  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 896 aa  1818    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.275954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3505  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 830 aa  253  9.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2131  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 		 757 aa  242  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0772564  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1352  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 		 832 aa  189  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  25.96 
 
 		 837 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 		 792 aa  129  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  23.67 
 
 		 860 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  25.35 
 
 		 843 aa  122  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  23.8 
 
 		 701 aa  122  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  24.51 
 
 		 708 aa  118  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  23.38 
 
 		 703 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  24.79 
 
 		 726 aa  115  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  25.03 
 
 		 707 aa  115  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  25.11 
 
 		 726 aa  114  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  23.55 
 
 		 825 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  24.63 
 
 		 741 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  23.7 
 
 		 825 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1049  TonB-dependent siderophore receptor  23.53 
 
 		 788 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  25.35 
 
 		 757 aa  111  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  24.89 
 
 		 734 aa  110  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  23.39 
 
 		 703 aa  110  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  23.25 
 
 		 778 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  23.92 
 
 		 800 aa  109  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  25.31 
 
 		 817 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  26.11 
 
 		 726 aa  108  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  21.86 
 
 		 817 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  25.55 
 
 		 816 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3412  ferrichrome iron receptor  25.21 
 
 		 691 aa  106  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000883951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  24.79 
 
 		 755 aa  105  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  22.17 
 
 		 807 aa  104  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 		 766 aa  104  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3521  TonB-dependent siderophore receptor  24.08 
 
 		 699 aa  104  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  23.86 
 
 		 701 aa  103  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  23.19 
 
 		 692 aa  103  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  21.4 
 
 		 824 aa  102  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4755  TonB-dependent siderophore receptor  22.75 
 
 		 797 aa  102  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.251254  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  22.62 
 
 		 696 aa  101  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  24.83 
 
 		 707 aa  101  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  24.02 
 
 		 721 aa  100  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  22.6 
 
 		 822 aa  99.4  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4624  TonB-dependent siderophore receptor  22.74 
 
 		 797 aa  99.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185618  decreased coverage  0.0000000123032 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  23.56 
 
 		 715 aa  99  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  25.17 
 
 		 803 aa  97.8  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1286  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 978 aa  97.4  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  25.59 
 
 		 793 aa  97.4  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  22.65 
 
 		 713 aa  96.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3225  TonB-dependent siderophore receptor  24.21 
 
 		 803 aa  96.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  23.95 
 
 		 708 aa  95.9  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  32.27 
 
 		 694 aa  95.5  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 799 aa  95.5  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  23.05 
 
 		 821 aa  95.1  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  23.42 
 
 		 799 aa  94.7  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  22.85 
 
 		 815 aa  94.7  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  22.05 
 
 		 696 aa  94.7  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4761  TonB-dependent siderophore receptor  22.05 
 
 		 797 aa  94.7  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  24.36 
 
 		 733 aa  94.4  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  23.46 
 
 		 717 aa  94.4  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 820 aa  94.4  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  25.32 
 
 		 836 aa  94  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  24.37 
 
 		 815 aa  94  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  23.87 
 
 		 697 aa  94  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000783326  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  26.79 
 
 		 808 aa  93.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  22.76 
 
 		 719 aa  92.8  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 		 799 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4307  TonB-dependent siderophore receptor  21.35 
 
 		 706 aa  93.6  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000234699  hitchhiker  0.000000000225287 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3841  TonB-dependent siderophore receptor  23.16 
 
 		 712 aa  93.2  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000249714  hitchhiker  0.000312087 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  22.2 
 
 		 705 aa  92.8  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4363  TonB-dependent siderophore receptor  21.35 
 
 		 706 aa  92.8  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  31.36 
 
 		 715 aa  92.4  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  23.18 
 
 		 710 aa  92  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  23.2 
 
 		 747 aa  92  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  23.48 
 
 		 714 aa  92  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  24.4 
 
 		 781 aa  92  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  23.37 
 
 		 731 aa  92  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 794 aa  92  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  22.77 
 
 		 717 aa  92  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  22.49 
 
 		 696 aa  91.7  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4362  TonB-dependent siderophore receptor  21.35 
 
 		 706 aa  91.7  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000023504  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 841 aa  91.7  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  27.83 
 
 		 863 aa  91.3  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  23.01 
 
 		 717 aa  91.3  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  22.16 
 
 		 803 aa  90.9  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  23.14 
 
 		 748 aa  91.3  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  25.21 
 
 		 812 aa  90.9  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  22.74 
 
 		 736 aa  90.5  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  24.76 
 
 		 751 aa  90.1  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  23.32 
 
 		 724 aa  90.1  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  24.81 
 
 		 710 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 		 833 aa  89.7  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 809 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 858 aa  89.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  24.09 
 
 		 772 aa  89.7  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 		 821 aa  90.1  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 743 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  24.43 
 
 		 712 aa  89.4  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  24.83 
 
 		 743 aa  89.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  25.45 
 
 		 779 aa  89  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 795 aa  89  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  23.17 
 
 		 721 aa  89  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>