More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0522 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0522  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 817 aa  1678    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  25.76 
 
 		 703 aa  158  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  25.26 
 
 		 708 aa  157  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  25.68 
 
 		 696 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  25.67 
 
 		 692 aa  144  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  25.06 
 
 		 709 aa  140  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  25.57 
 
 		 710 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1286  TonB-dependent receptor plug  30.52 
 
 		 978 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1267  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 980 aa  124  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  24.09 
 
 		 708 aa  124  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  24.22 
 
 		 689 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  23.79 
 
 		 711 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  23.29 
 
 		 708 aa  118  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  23.75 
 
 		 709 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  24.66 
 
 		 730 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  23.55 
 
 		 825 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  23.39 
 
 		 825 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  24.39 
 
 		 817 aa  108  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2928  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 1245 aa  102  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  23.62 
 
 		 689 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  31.49 
 
 		 860 aa  94.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  22.38 
 
 		 711 aa  94.4  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2048  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 929 aa  94  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.221244  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  22.77 
 
 		 701 aa  93.2  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  29.5 
 
 		 862 aa  91.7  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  21.64 
 
 		 745 aa  91.3  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  21.46 
 
 		 723 aa  90.9  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  22.71 
 
 		 722 aa  89.7  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  30.95 
 
 		 696 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3766  TonB-dependent receptor plug  30.49 
 
 		 1146 aa  89.7  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  32.21 
 
 		 741 aa  89.4  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  22.81 
 
 		 707 aa  89.4  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2317  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 1202 aa  89  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  30.89 
 
 		 843 aa  88.6  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1755  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1289 aa  88.2  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 828 aa  87.8  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  27.98 
 
 		 863 aa  87.4  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2495  TonB-dependent receptor plug  31.9 
 
 		 1247 aa  87.4  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1125  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 967 aa  87  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  28.52 
 
 		 726 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  21.62 
 
 		 815 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.82 
 
 		 833 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4278  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 1146 aa  86.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  21.17 
 
 		 724 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1352  TonB-dependent receptor plug  22.14 
 
 		 832 aa  85.5  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  22.4 
 
 		 833 aa  85.5  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  30.13 
 
 		 703 aa  85.1  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  30.13 
 
 		 701 aa  85.1  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  28.37 
 
 		 736 aa  85.1  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  22.06 
 
 		 819 aa  84.3  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  21.19 
 
 		 724 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 726 aa  84.3  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1794  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 1302 aa  83.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4280  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 1144 aa  83.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  23.16 
 
 		 689 aa  84  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.68 
 
 		 703 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  21.3 
 
 		 787 aa  82.8  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  23.07 
 
 		 707 aa  83.2  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1013  TonB-dependent receptor plug  25.76 
 
 		 1273 aa  82.8  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  21.4 
 
 		 715 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003567  ferrichrome-iron receptor  22.3 
 
 		 740 aa  82.4  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 732 aa  82  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1754  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1243 aa  82  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 714 aa  82  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0596  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1245 aa  82  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  23.89 
 
 		 701 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  30.51 
 
 		 837 aa  80.9  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  23.89 
 
 		 701 aa  80.9  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  24.22 
 
 		 703 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 743 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  22.42 
 
 		 722 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1676  TonB-dependent siderophore receptor  28.64 
 
 		 757 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  22.19 
 
 		 712 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3377  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1314 aa  79.7  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615766  normal  0.66786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4279  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 1153 aa  79.7  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  23.66 
 
 		 771 aa  79.3  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1281  TonB-dependent siderophore receptor  28.94 
 
 		 699 aa  79.3  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  30.48 
 
 		 821 aa  78.6  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 		 745 aa  78.6  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3723  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 767 aa  78.6  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  29.72 
 
 		 715 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0338  ferrioxamine B receptor precursor protein  26.48 
 
 		 705 aa  78.2  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.203857  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 		 719 aa  78.2  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 701 aa  77.8  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  22.58 
 
 		 696 aa  77.8  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 		 734 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  30.54 
 
 		 782 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  22.3 
 
 		 738 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  22.17 
 
 		 738 aa  77  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  29.77 
 
 		 712 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  28.95 
 
 		 749 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  31.64 
 
 		 721 aa  76.6  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  21.18 
 
 		 828 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3863  TonB-dependent siderophore receptor  25.86 
 
 		 733 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000567085  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  24.11 
 
 		 810 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  22.06 
 
 		 728 aa  75.5  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2318  TonB-dependent siderophore receptor  22.82 
 
 		 779 aa  75.1  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  27.05 
 
 		 864 aa  75.1  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 		 755 aa  75.1  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  30.7 
 
 		 715 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>