More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1794 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1794  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1302 aa  2646    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1755  TonB-dependent receptor plug  33.96 
 
 		 1289 aa  655    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1754  TonB-dependent receptor plug  37.81 
 
 		 1243 aa  689    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1991  TonB-dependent receptor plug  34.16 
 
 		 1243 aa  610  1e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302175  normal  0.112109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0596  TonB-dependent receptor plug  34.1 
 
 		 1245 aa  599  1e-169  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0600  TonB-dependent receptor plug  32.97 
 
 		 1294 aa  567  1e-160  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2495  TonB-dependent receptor plug  32.99 
 
 		 1247 aa  557  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3377  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 		 1314 aa  538  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615766  normal  0.66786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3234  TonB-dependent receptor plug  30.35 
 
 		 1221 aa  479  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763048  normal  0.0174911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2317  TonB-dependent receptor plug  38.31 
 
 		 1202 aa  400  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3766  TonB-dependent receptor plug  35.66 
 
 		 1146 aa  337  7.999999999999999e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3199  TonB-dependent receptor plug  30.11 
 
 		 1297 aa  314  6.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2928  TonB-dependent receptor plug  34.09 
 
 		 1245 aa  289  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1013  TonB-dependent receptor plug  47.33 
 
 		 1273 aa  266  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2901  TonB-dependent receptor plug  39.46 
 
 		 1134 aa  193  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.269795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4279  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 1153 aa  167  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4278  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1146 aa  167  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1349  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 1232 aa  160  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4280  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 1144 aa  158  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2048  TonB-dependent receptor  35.1 
 
 		 929 aa  157  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.221244  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4266  TonB-dependent receptor plug  38.89 
 
 		 1091 aa  140  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4287  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 		 1149 aa  135  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1286  TonB-dependent receptor plug  34.51 
 
 		 978 aa  115  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1267  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 980 aa  103  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1125  TonB-dependent receptor plug  32.51 
 
 		 967 aa  87.8  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304926 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  29 
 
 		 755 aa  79.7  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  23.57 
 
 		 701 aa  73.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0522  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 817 aa  72.4  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  29.41 
 
 		 727 aa  72.4  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 		 694 aa  68.6  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1352  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 832 aa  68.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3521  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 		 699 aa  67.8  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 		 715 aa  67  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4135  ferrioxamine B receptor precursor protein  26.52 
 
 		 726 aa  66.6  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156472  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 736 aa  66.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  22.79 
 
 		 701 aa  66.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 734 aa  66.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 		 734 aa  65.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  22.79 
 
 		 701 aa  65.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.14 
 
 		 833 aa  65.5  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  26.11 
 
 		 732 aa  65.5  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3560  TonB-dependent siderophore receptor  29.8 
 
 		 710 aa  65.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 		 710 aa  65.1  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 		 770 aa  65.1  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  23.44 
 
 		 701 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 829 aa  65.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 732 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  26.53 
 
 		 708 aa  65.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  27.95 
 
 		 742 aa  63.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  25.69 
 
 		 710 aa  63.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1440  TonB dependent, hydroxamate-type ferrisiderophore, outer membrane receptor  28.64 
 
 		 699 aa  63.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453975  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  27.95 
 
 		 742 aa  63.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  31.06 
 
 		 735 aa  63.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3640  TonB-dependent siderophore receptor  24.44 
 
 		 708 aa  63.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168279  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  23.05 
 
 		 701 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  23.05 
 
 		 701 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0089  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 699 aa  64.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.26085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1617  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  24.07 
 
 		 728 aa  62.8  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000544721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3722  TonB-dependent receptor plug  26.73 
 
 		 896 aa  63.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.275954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 		 712 aa  62.4  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  24.53 
 
 		 771 aa  62  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  22.14 
 
 		 701 aa  62  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 745 aa  62  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  29.19 
 
 		 860 aa  61.6  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  28.07 
 
 		 751 aa  61.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  23.37 
 
 		 707 aa  61.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 		 709 aa  61.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0947  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 		 683 aa  61.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0779656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 		 726 aa  61.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003567  ferrichrome-iron receptor  31.52 
 
 		 740 aa  60.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  26.61 
 
 		 703 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3330  hypothetical protein  24.73 
 
 		 714 aa  60.1  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.641382  normal  0.572781 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0837  TonB-dependent siderophore receptor  27.39 
 
 		 759 aa  60.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213171  normal  0.109269 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4395  TonB-dependent siderophore receptor  26.81 
 
 		 756 aa  60.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  25.96 
 
 		 701 aa  59.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  27.32 
 
 		 745 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  25.37 
 
 		 719 aa  58.9  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  26.98 
 
 		 747 aa  58.9  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5955  TonB-dependent siderophore receptor  25.31 
 
 		 877 aa  58.9  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0124539 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2131  TonB-dependent receptor plug  26.13 
 
 		 757 aa  58.9  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0772564  normal  0.485646 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  27.27 
 
 		 747 aa  58.5  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  30.05 
 
 		 747 aa  58.5  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  28.27 
 
 		 748 aa  58.5  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  27.27 
 
 		 745 aa  58.5  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  28.27 
 
 		 748 aa  58.5  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  26.87 
 
 		 716 aa  58.5  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  26.37 
 
 		 797 aa  58.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  28.27 
 
 		 740 aa  58.5  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  26.98 
 
 		 752 aa  57.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  27.86 
 
 		 696 aa  58.2  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  27.27 
 
 		 747 aa  57.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  28.5 
 
 		 748 aa  57.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 753 aa  58.2  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  27.27 
 
 		 747 aa  57.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2977  TonB-dependent receptor, plug  24 
 
 		 518 aa  58.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826241  normal  0.256941 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  26.98 
 
 		 747 aa  58.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3085  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 		 767 aa  57.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal  0.216415 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  24.52 
 
 		 703 aa  57.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4026  TonB-dependent siderophore receptor  25.53 
 
 		 755 aa  57.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.865466  normal  0.196913 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  24.9 
 
 		 728 aa  57.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>