More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2495 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1013  TonB-dependent receptor plug  35.56 
 
 		 1273 aa  642    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1991  TonB-dependent receptor plug  36.79 
 
 		 1243 aa  647    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302175  normal  0.112109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0596  TonB-dependent receptor plug  37.22 
 
 		 1245 aa  674    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0600  TonB-dependent receptor plug  36.58 
 
 		 1294 aa  667    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2495  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1247 aa  2534    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3377  TonB-dependent receptor plug  50.81 
 
 		 1314 aa  1172    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615766  normal  0.66786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1755  TonB-dependent receptor plug  33.16 
 
 		 1289 aa  557  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1754  TonB-dependent receptor plug  35.47 
 
 		 1243 aa  550  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1794  TonB-dependent receptor plug  32.99 
 
 		 1302 aa  543  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3234  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1221 aa  540  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763048  normal  0.0174911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2317  TonB-dependent receptor plug  32.45 
 
 		 1202 aa  506  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3199  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 1297 aa  356  1e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3766  TonB-dependent receptor plug  33.02 
 
 		 1146 aa  328  4.0000000000000003e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2928  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 1245 aa  248  6.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2901  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 		 1134 aa  240  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.269795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1349  TonB-dependent receptor plug  38.24 
 
 		 1232 aa  177  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4280  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 1144 aa  171  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4279  TonB-dependent receptor plug  30.59 
 
 		 1153 aa  164  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4278  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 1146 aa  161  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4266  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 1091 aa  158  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4287  TonB-dependent receptor plug  34.7 
 
 		 1149 aa  151  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2048  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 929 aa  139  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.221244  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1267  TonB-dependent receptor  32.33 
 
 		 980 aa  120  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1286  TonB-dependent receptor plug  35.14 
 
 		 978 aa  118  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 727 aa  84  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1125  TonB-dependent receptor plug  28.86 
 
 		 967 aa  80.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304926 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2131  TonB-dependent receptor plug  30.85 
 
 		 757 aa  77.8  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0772564  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  29.44 
 
 		 755 aa  77  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  26.5 
 
 		 743 aa  75.5  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0522  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 817 aa  75.5  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1281  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 		 699 aa  73.2  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 		 726 aa  73.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  27.04 
 
 		 732 aa  72.8  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  26.05 
 
 		 701 aa  72.4  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  29.59 
 
 		 689 aa  71.6  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  25.09 
 
 		 703 aa  71.6  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  27.56 
 
 		 703 aa  71.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  25.91 
 
 		 712 aa  70.9  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  23.87 
 
 		 701 aa  70.1  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  27.23 
 
 		 708 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 		 724 aa  69.7  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 		 724 aa  70.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3722  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 896 aa  70.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.275954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  25.7 
 
 		 726 aa  69.3  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3560  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 		 710 aa  69.3  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  25.79 
 
 		 732 aa  68.6  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  25.55 
 
 		 692 aa  68.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 737 aa  67  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  26.25 
 
 		 747 aa  67.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1961  TonB-dependent siderophore receptor  26.58 
 
 		 705 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353089 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  30.68 
 
 		 735 aa  66.2  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  26.67 
 
 		 747 aa  65.5  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  26.67 
 
 		 745 aa  65.5  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  27.15 
 
 		 710 aa  65.1  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  26.67 
 
 		 747 aa  65.1  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  26.67 
 
 		 747 aa  65.1  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  26.25 
 
 		 752 aa  64.7  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  29.41 
 
 		 850 aa  64.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  25.75 
 
 		 708 aa  64.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  26.61 
 
 		 860 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  26.1 
 
 		 771 aa  64.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.27 
 
 		 833 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.93 
 
 		 703 aa  63.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3723  TonB-dependent receptor plug  23.7 
 
 		 767 aa  63.5  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  23.24 
 
 		 721 aa  63.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0947  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 		 683 aa  63.5  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0779656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1541  TonB-dependent siderophore receptor  24.1 
 
 		 750 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0957373  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 		 694 aa  63.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 701 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  28.74 
 
 		 711 aa  63.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1562  TonB-dependent siderophore receptor  24.89 
 
 		 753 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000416689  normal  0.182143 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 701 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3097  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 		 723 aa  62.8  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001067  ferric siderophore receptor PsuA  27.24 
 
 		 678 aa  62.4  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 734 aa  62.4  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 		 722 aa  62.4  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  26.82 
 
 		 696 aa  62  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  23.55 
 
 		 708 aa  62  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  26.07 
 
 		 734 aa  62  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1078  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 748 aa  61.6  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 715 aa  61.6  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 736 aa  61.6  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  26.67 
 
 		 703 aa  61.6  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 715 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  24.67 
 
 		 740 aa  61.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  29.61 
 
 		 747 aa  60.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  29.61 
 
 		 747 aa  60.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 		 730 aa  60.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  24.67 
 
 		 748 aa  60.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  25.44 
 
 		 736 aa  60.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 		 722 aa  60.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  29.03 
 
 		 707 aa  60.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  24.41 
 
 		 741 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3505  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 830 aa  60.1  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  24.67 
 
 		 748 aa  60.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0725  TonB-dependent receptor protein  25.22 
 
 		 633 aa  59.7  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 851 aa  59.7  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  26.54 
 
 		 701 aa  60.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  25.39 
 
 		 723 aa  59.7  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  24.18 
 
 		 726 aa  60.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>