205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4279 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4280  TonB-dependent receptor plug  51.36 
 
 		 1144 aa  1144    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4279  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1153 aa  2360    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4287  TonB-dependent receptor plug  45.08 
 
 		 1149 aa  916    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4278  TonB-dependent receptor plug  54.17 
 
 		 1146 aa  1195    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4266  TonB-dependent receptor plug  34.17 
 
 		 1091 aa  560  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1349  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 1232 aa  402  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3766  TonB-dependent receptor plug  26.3 
 
 		 1146 aa  176  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1794  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 1302 aa  165  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2928  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 1245 aa  165  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2495  TonB-dependent receptor plug  30.59 
 
 		 1247 aa  164  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3377  TonB-dependent receptor plug  37.92 
 
 		 1314 aa  164  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615766  normal  0.66786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1991  TonB-dependent receptor plug  33.22 
 
 		 1243 aa  155  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302175  normal  0.112109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0596  TonB-dependent receptor plug  32.33 
 
 		 1245 aa  150  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2317  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 1202 aa  144  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3234  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 		 1221 aa  143  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763048  normal  0.0174911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1013  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 1273 aa  138  7.000000000000001e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0600  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 1294 aa  137  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2901  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1134 aa  134  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.269795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3199  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 		 1297 aa  131  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1754  TonB-dependent receptor plug  34.6 
 
 		 1243 aa  123  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1755  TonB-dependent receptor plug  31.41 
 
 		 1289 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2048  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 929 aa  107  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.221244  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1286  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 978 aa  85.9  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0522  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 817 aa  78.2  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1125  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 967 aa  70.1  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304926 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1267  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 980 aa  68.6  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3722  TonB-dependent receptor plug  26.56 
 
 		 896 aa  62  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.275954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  28.72 
 
 		 735 aa  61.6  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  24.7 
 
 		 841 aa  60.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  24.6 
 
 		 722 aa  60.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2088  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 793 aa  59.3  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0823412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  27.68 
 
 		 757 aa  58.9  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  25.74 
 
 		 755 aa  58.9  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  23.98 
 
 		 701 aa  58.5  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  24.66 
 
 		 801 aa  57.4  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  24.77 
 
 		 703 aa  58.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1823  TonB-dependent siderophore receptor  29.05 
 
 		 696 aa  57  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.077851  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3335  TonB-dependent receptor, plug  30.48 
 
 		 794 aa  56.6  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  26.25 
 
 		 692 aa  57  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  29.85 
 
 		 722 aa  56.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00772  predicted iron outer membrane transporter  25.21 
 
 		 760 aa  56.2  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2837  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 760 aa  56.2  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2838  catecholate siderophore receptor Fiu  25.21 
 
 		 760 aa  56.2  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.167931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0954  catecholate siderophore receptor Fiu  25.21 
 
 		 760 aa  56.2  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.691601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00789  hypothetical protein  25.21 
 
 		 760 aa  56.2  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0860  catecholate siderophore receptor Fiu  25.21 
 
 		 760 aa  56.2  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0873  catecholate siderophore receptor Fiu  25.21 
 
 		 760 aa  56.2  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  25.69 
 
 		 708 aa  55.5  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0829  catecholate siderophore receptor Fiu  25.21 
 
 		 760 aa  55.5  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0540  TonB-dependent siderophore receptor  29.78 
 
 		 718 aa  55.5  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  33.91 
 
 		 707 aa  55.1  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3969  TonB-dependent siderophore receptor  30.81 
 
 		 793 aa  54.7  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.69 
 
 		 711 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  26.24 
 
 		 722 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.54 
 
 		 703 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 		 708 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  25.33 
 
 		 722 aa  53.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  30.97 
 
 		 720 aa  53.5  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  27.18 
 
 		 708 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  24.03 
 
 		 716 aa  53.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0603  TonB-dependent siderophore receptor  29.91 
 
 		 716 aa  53.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00298801  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  28.95 
 
 		 822 aa  53.5  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  26.9 
 
 		 703 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  25.12 
 
 		 723 aa  53.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  22.46 
 
 		 715 aa  53.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  24.05 
 
 		 727 aa  52.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  29.27 
 
 		 862 aa  52.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  23.69 
 
 		 831 aa  52.4  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 827 aa  52.4  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 		 712 aa  52  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  26.34 
 
 		 711 aa  52  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 		 732 aa  52  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 734 aa  51.6  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  30.19 
 
 		 736 aa  52  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  36.46 
 
 		 699 aa  51.6  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3521  TonB-dependent siderophore receptor  22.13 
 
 		 699 aa  51.6  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  27.54 
 
 		 701 aa  51.6  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1352  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 832 aa  51.6  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 780 aa  51.6  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2724  FhuE receptor  28.57 
 
 		 707 aa  51.2  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 850 aa  50.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 		 714 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 		 732 aa  51.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  23.1 
 
 		 694 aa  51.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 		 732 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  24.11 
 
 		 836 aa  51.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3097  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 		 723 aa  51.2  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  22.26 
 
 		 710 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 781 aa  51.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  24.19 
 
 		 745 aa  50.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03559  putative outer membrane receptor for iron transport  25.78 
 
 		 761 aa  50.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143456  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0530  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 767 aa  50.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.898854  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3717  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 726 aa  50.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0514  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 768 aa  50.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400369  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3723  TonB-dependent receptor plug  27.83 
 
 		 767 aa  50.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 780 aa  50.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  24.88 
 
 		 730 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  22.81 
 
 		 745 aa  50.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0837  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 759 aa  50.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213171  normal  0.109269 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 708 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>