More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1823 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1823  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 696 aa  1403    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.077851  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0311  TonB-dependent siderophore receptor  36.87 
 
 		 697 aa  434  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000107098  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  37.05 
 
 		 720 aa  413  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00133  FhuE receptor  34.85 
 
 		 697 aa  409  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3277  TonB-dependent siderophore receptor  36.35 
 
 		 702 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.85101  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3929  TonB-dependent siderophore receptor  36.35 
 
 		 702 aa  409  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2549  TonB-dependent siderophore receptor  34.14 
 
 		 700 aa  395  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133657  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3097  TonB-dependent siderophore receptor  34.92 
 
 		 723 aa  391  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582192  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2724  FhuE receptor  34.25 
 
 		 707 aa  382  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3717  TonB-dependent siderophore receptor  33.94 
 
 		 726 aa  382  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0603  TonB-dependent siderophore receptor  34.97 
 
 		 716 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00298801  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0540  TonB-dependent siderophore receptor  34.44 
 
 		 718 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2798  TonB-dependent receptor  32.06 
 
 		 686 aa  372  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000816891  hitchhiker  0.0000136093 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3064  TonB-dependent siderophore receptor  34.33 
 
 		 712 aa  375  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  34 
 
 		 725 aa  360  4e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2342  TonB-dependent siderophore receptor  31.29 
 
 		 693 aa  293  8e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000105633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2121  TonB-dependent siderophore receptor  31.15 
 
 		 693 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000812539  normal  0.443663 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1082  TonB-dependent siderophore receptor  32.02 
 
 		 730 aa  292  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  30.67 
 
 		 714 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  32.58 
 
 		 840 aa  285  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3863  TonB-dependent siderophore receptor  28.77 
 
 		 733 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000567085  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1841  TonB-dependent siderophore receptor  29.08 
 
 		 696 aa  274  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000240616  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.86 
 
 		 747 aa  272  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  31.05 
 
 		 723 aa  272  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 		 816 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1326  TonB-dependent siderophore receptor  29.84 
 
 		 741 aa  270  7e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624497  normal  0.0240469 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  30.22 
 
 		 815 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0950  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 		 723 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000152119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  30.45 
 
 		 766 aa  263  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2124  TonB-dependent siderophore receptor  28.34 
 
 		 722 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000170131  normal  0.221939 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0988  TonB-dependent siderophore receptor  28.8 
 
 		 731 aa  263  6e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00021194  normal  0.772446 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0952  TonB-dependent siderophore receptor  28.32 
 
 		 729 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000770151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  29.9 
 
 		 741 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 		 735 aa  261  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  29.65 
 
 		 741 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2136  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 		 722 aa  260  7e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.503645  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  28.47 
 
 		 724 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  28.61 
 
 		 724 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  28.47 
 
 		 724 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  28.61 
 
 		 724 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  29.99 
 
 		 732 aa  258  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2733  TonB-dependent siderophore receptor  29.78 
 
 		 747 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000321343  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  28.83 
 
 		 729 aa  257  5e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2339  TonB-dependent siderophore receptor  28.34 
 
 		 722 aa  257  5e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000312883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  28.83 
 
 		 729 aa  257  6e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  28.2 
 
 		 753 aa  257  6e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  28.83 
 
 		 729 aa  257  6e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  28.83 
 
 		 729 aa  256  7e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  28.83 
 
 		 729 aa  256  7e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  28.83 
 
 		 729 aa  256  7e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  28.83 
 
 		 729 aa  256  7e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  28.83 
 
 		 729 aa  256  7e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  28.9 
 
 		 729 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  28.47 
 
 		 724 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1617  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.36 
 
 		 728 aa  254  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000544721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  28.26 
 
 		 753 aa  254  5.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0137  TonB-dependent iron-siderophore receptor precursor  27.31 
 
 		 721 aa  253  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 		 827 aa  252  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2812  TonB-dependent siderophore receptor  29.38 
 
 		 747 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215946  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2414  TonB-dependent siderophore receptor  28.3 
 
 		 737 aa  248  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486485  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  29.73 
 
 		 806 aa  246  8e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  28.93 
 
 		 723 aa  246  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  28.94 
 
 		 814 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  29.65 
 
 		 808 aa  244  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3033  ferric alcaligin siderophore receptor  29.85 
 
 		 700 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1517  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 		 737 aa  243  6e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134645  normal  0.877607 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 802 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1451  TonB-dependent siderophore receptor  28.75 
 
 		 737 aa  238  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1507  TonB-dependent siderophore receptor  28.75 
 
 		 737 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.681157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  28.74 
 
 		 798 aa  237  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  27.86 
 
 		 795 aa  235  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 		 748 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3182  TonB-dependent receptor family protein  26.91 
 
 		 699 aa  233  6e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.223092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3531  TonB-dependent siderophore receptor  29.19 
 
 		 740 aa  233  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313722  decreased coverage  0.00643483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  28.72 
 
 		 812 aa  233  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 722 aa  231  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  27.87 
 
 		 799 aa  230  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 		 722 aa  230  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  28.99 
 
 		 789 aa  229  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  29.66 
 
 		 801 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  28.7 
 
 		 840 aa  227  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 		 803 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  29.39 
 
 		 803 aa  225  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  29.11 
 
 		 724 aa  224  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  28.72 
 
 		 807 aa  224  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  28.87 
 
 		 703 aa  223  7e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  27.62 
 
 		 802 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  28.57 
 
 		 810 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 		 717 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  28.11 
 
 		 833 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1999  outer membrane receptor for Fe  26.43 
 
 		 706 aa  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.928723  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  30.27 
 
 		 778 aa  213  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 		 822 aa  213  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 817 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  28.77 
 
 		 841 aa  212  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  28.16 
 
 		 812 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  27.63 
 
 		 819 aa  210  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0106  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 728 aa  210  8e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0114  TonB-dependent siderophore receptor  26.84 
 
 		 728 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4286  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 		 728 aa  207  5e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>