More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4280 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4279  TonB-dependent receptor plug  51.36 
 
 		 1153 aa  1129    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4278  TonB-dependent receptor plug  57.25 
 
 		 1146 aa  1274    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4287  TonB-dependent receptor plug  48.17 
 
 		 1149 aa  1016    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4280  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1144 aa  2354    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4266  TonB-dependent receptor plug  35.09 
 
 		 1091 aa  595  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1349  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1232 aa  473  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3766  TonB-dependent receptor plug  25.15 
 
 		 1146 aa  256  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2317  TonB-dependent receptor plug  24.6 
 
 		 1202 aa  242  4e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0596  TonB-dependent receptor plug  25.48 
 
 		 1245 aa  229  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2928  TonB-dependent receptor plug  24.22 
 
 		 1245 aa  194  6e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2495  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 		 1247 aa  171  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3377  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 		 1314 aa  147  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615766  normal  0.66786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3234  TonB-dependent receptor plug  33.8 
 
 		 1221 aa  143  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763048  normal  0.0174911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1794  TonB-dependent receptor plug  33.22 
 
 		 1302 aa  141  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1755  TonB-dependent receptor plug  32.11 
 
 		 1289 aa  140  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3199  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 1297 aa  139  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1991  TonB-dependent receptor plug  31.07 
 
 		 1243 aa  138  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302175  normal  0.112109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1013  TonB-dependent receptor plug  30.85 
 
 		 1273 aa  134  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2901  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1134 aa  131  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.269795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0600  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1294 aa  129  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1754  TonB-dependent receptor plug  30.9 
 
 		 1243 aa  120  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2048  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 929 aa  108  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.221244  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1286  TonB-dependent receptor plug  27.68 
 
 		 978 aa  86.3  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0522  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 817 aa  75.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  25.94 
 
 		 703 aa  70.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3722  TonB-dependent receptor plug  31.89 
 
 		 896 aa  69.3  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.275954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1267  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 980 aa  68.9  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  24.12 
 
 		 723 aa  68.6  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1006  TonB-dependent siderophore receptor  28.94 
 
 		 726 aa  67.8  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 		 692 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  25.29 
 
 		 755 aa  66.6  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  25.11 
 
 		 708 aa  67.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003567  ferrichrome-iron receptor  27.78 
 
 		 740 aa  65.9  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 725 aa  65.5  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  27.88 
 
 		 722 aa  65.5  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3717  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 		 726 aa  63.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  27.47 
 
 		 722 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  31.18 
 
 		 822 aa  63.2  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4286  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 		 728 aa  62.4  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4426  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 		 728 aa  62.4  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0114  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 		 728 aa  62.4  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2131  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 		 757 aa  62  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0772564  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1125  TonB-dependent receptor plug  24.29 
 
 		 967 aa  61.6  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304926 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0106  TonB-dependent siderophore receptor  24.22 
 
 		 728 aa  60.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 		 809 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 689 aa  61.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 724 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  24.49 
 
 		 735 aa  59.3  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0089  TonB-dependent siderophore receptor  23.3 
 
 		 699 aa  58.9  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.26085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2275  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 779 aa  58.5  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00175316  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 803 aa  58.5  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  26.13 
 
 		 833 aa  58.5  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  23.71 
 
 		 709 aa  58.5  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  24.73 
 
 		 748 aa  58.5  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0530  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 767 aa  58.5  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.898854  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3723  TonB-dependent receptor plug  31.19 
 
 		 767 aa  58.5  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0514  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 768 aa  58.5  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400369  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1440  TonB dependent, hydroxamate-type ferrisiderophore, outer membrane receptor  23.3 
 
 		 699 aa  58.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453975  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.31 
 
 		 825 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  23.47 
 
 		 748 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 		 736 aa  57.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 731 aa  57.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 		 734 aa  57.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 		 734 aa  56.6  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  25.99 
 
 		 810 aa  57  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  23.83 
 
 		 703 aa  57  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 828 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  24.29 
 
 		 738 aa  57  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  28.24 
 
 		 844 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 828 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  24.22 
 
 		 736 aa  57  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 731 aa  57  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  25.23 
 
 		 840 aa  57  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  25.91 
 
 		 730 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 828 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 717 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  27.24 
 
 		 719 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  27.57 
 
 		 701 aa  56.2  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1823  TonB-dependent siderophore receptor  26.8 
 
 		 696 aa  56.6  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.077851  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  25.15 
 
 		 732 aa  56.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 780 aa  56.2  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 		 722 aa  56.2  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 701 aa  55.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1676  TonB-dependent siderophore receptor  31.16 
 
 		 757 aa  55.8  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  24.48 
 
 		 741 aa  56.2  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  23.66 
 
 		 821 aa  56.2  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  24.48 
 
 		 737 aa  55.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  23.96 
 
 		 708 aa  55.8  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  24.48 
 
 		 736 aa  56.2  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  24.48 
 
 		 736 aa  56.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  24.48 
 
 		 752 aa  55.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  24.48 
 
 		 753 aa  56.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  24.48 
 
 		 753 aa  56.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 		 730 aa  55.8  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0603  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 716 aa  55.8  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00298801  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 731 aa  55.8  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  23.13 
 
 		 729 aa  55.5  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  23.13 
 
 		 729 aa  55.5  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 797 aa  55.5  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  24.88 
 
 		 735 aa  55.5  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>