More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3199 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1991  TonB-dependent receptor plug  53.12 
 
 		 1243 aa  1280    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302175  normal  0.112109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0596  TonB-dependent receptor plug  52.38 
 
 		 1245 aa  1255    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1013  TonB-dependent receptor plug  39.49 
 
 		 1273 aa  768    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3234  TonB-dependent receptor plug  36.89 
 
 		 1221 aa  716    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763048  normal  0.0174911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3377  TonB-dependent receptor plug  36.08 
 
 		 1314 aa  652    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615766  normal  0.66786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0600  TonB-dependent receptor plug  47.33 
 
 		 1294 aa  1108    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3199  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1297 aa  2651    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1794  TonB-dependent receptor plug  31.79 
 
 		 1302 aa  530  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1754  TonB-dependent receptor plug  32.25 
 
 		 1243 aa  503  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2495  TonB-dependent receptor plug  31.32 
 
 		 1247 aa  345  2.9999999999999997e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2317  TonB-dependent receptor plug  36.77 
 
 		 1202 aa  337  7e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1755  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 		 1289 aa  306  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2928  TonB-dependent receptor plug  32.33 
 
 		 1245 aa  281  7e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3766  TonB-dependent receptor plug  47.02 
 
 		 1146 aa  245  3.9999999999999997e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2901  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 		 1134 aa  233  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.269795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2048  TonB-dependent receptor  37.87 
 
 		 929 aa  155  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.221244  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4287  TonB-dependent receptor plug  34.44 
 
 		 1149 aa  151  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4280  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 1144 aa  149  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1349  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 1232 aa  149  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4279  TonB-dependent receptor plug  32.3 
 
 		 1153 aa  143  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4278  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1146 aa  139  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4266  TonB-dependent receptor plug  32.98 
 
 		 1091 aa  126  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1286  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 		 978 aa  98.6  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1267  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 980 aa  87.8  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1125  TonB-dependent receptor plug  30.37 
 
 		 967 aa  82.8  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304926 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2131  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 757 aa  70.5  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0772564  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  24.01 
 
 		 732 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  27.93 
 
 		 727 aa  70.5  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  25.97 
 
 		 694 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  26.34 
 
 		 710 aa  68.6  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 		 755 aa  68.6  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  28.5 
 
 		 814 aa  67.8  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  24.66 
 
 		 692 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0089  TonB-dependent siderophore receptor  25.73 
 
 		 699 aa  67.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.26085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  24.81 
 
 		 737 aa  66.2  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  25.09 
 
 		 715 aa  66.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  26.56 
 
 		 701 aa  66.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3560  TonB-dependent siderophore receptor  31.31 
 
 		 710 aa  65.9  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  26.05 
 
 		 701 aa  65.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1440  TonB dependent, hydroxamate-type ferrisiderophore, outer membrane receptor  25.41 
 
 		 699 aa  65.5  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453975  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  26.05 
 
 		 701 aa  65.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25 
 
 		 703 aa  65.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  27.11 
 
 		 701 aa  65.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  23.31 
 
 		 703 aa  64.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  25.33 
 
 		 734 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  30.41 
 
 		 689 aa  64.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 701 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  24.02 
 
 		 732 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 701 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 701 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1808  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 739 aa  63.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  28.24 
 
 		 722 aa  63.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  25.57 
 
 		 708 aa  63.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  25.42 
 
 		 745 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  24.89 
 
 		 734 aa  63.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  24.89 
 
 		 736 aa  63.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  26.48 
 
 		 707 aa  62.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  21.79 
 
 		 738 aa  62.8  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5955  TonB-dependent siderophore receptor  28.44 
 
 		 877 aa  62.4  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0124539 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  26.37 
 
 		 710 aa  62.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  21.26 
 
 		 753 aa  62.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  21.26 
 
 		 753 aa  62.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  21.26 
 
 		 737 aa  62.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  21.26 
 
 		 741 aa  62  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  21.26 
 
 		 752 aa  62  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  21.26 
 
 		 736 aa  62  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  25.12 
 
 		 792 aa  62  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  21.26 
 
 		 736 aa  62  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  24.41 
 
 		 734 aa  62  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2399  TonB-dependent siderophore receptor  22.83 
 
 		 729 aa  61.6  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  24.24 
 
 		 703 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 701 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  26.27 
 
 		 757 aa  60.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1352  TonB-dependent receptor plug  25.45 
 
 		 832 aa  61.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  26.38 
 
 		 776 aa  61.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 723 aa  60.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  28.97 
 
 		 730 aa  60.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  29.29 
 
 		 733 aa  60.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0530  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 767 aa  60.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.898854  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 		 736 aa  60.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  26.45 
 
 		 743 aa  60.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4790  TonB-dependent siderophore receptor  22.54 
 
 		 750 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  23.58 
 
 		 701 aa  60.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1281  TonB-dependent siderophore receptor  28.64 
 
 		 699 aa  60.1  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1164  TonB-dependent siderophore receptor  23.77 
 
 		 754 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0408687  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1644  TonB-dependent siderophore receptor  23.77 
 
 		 754 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107171  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0514  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 768 aa  60.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400369  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  24.26 
 
 		 689 aa  59.7  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 		 723 aa  59.7  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1619  TonB-dependent siderophore receptor  23.77 
 
 		 754 aa  60.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285071 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  24.88 
 
 		 708 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1562  TonB-dependent siderophore receptor  23.36 
 
 		 753 aa  59.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000416689  normal  0.182143 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1541  TonB-dependent siderophore receptor  23.36 
 
 		 750 aa  59.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0957373  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  24.89 
 
 		 745 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  24.19 
 
 		 749 aa  59.3  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  24.88 
 
 		 703 aa  59.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  23.89 
 
 		 833 aa  58.9  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.15 
 
 		 711 aa  58.9  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 		 753 aa  58.9  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  26.32 
 
 		 728 aa  58.9  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>