253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1754 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1794  TonB-dependent receptor plug  38.18 
 
 		 1302 aa  714    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1755  TonB-dependent receptor plug  41.84 
 
 		 1289 aa  889    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1754  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1243 aa  2520    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1991  TonB-dependent receptor plug  35.7 
 
 		 1243 aa  618  1e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302175  normal  0.112109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3377  TonB-dependent receptor plug  36.54 
 
 		 1314 aa  609  9.999999999999999e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615766  normal  0.66786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2317  TonB-dependent receptor plug  34.74 
 
 		 1202 aa  596  1e-169  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0600  TonB-dependent receptor plug  34.42 
 
 		 1294 aa  595  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2495  TonB-dependent receptor plug  35.34 
 
 		 1247 aa  580  1e-164  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3199  TonB-dependent receptor plug  32.25 
 
 		 1297 aa  523  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3766  TonB-dependent receptor plug  32.42 
 
 		 1146 aa  501  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0596  TonB-dependent receptor plug  35.4 
 
 		 1245 aa  482  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2928  TonB-dependent receptor plug  30.66 
 
 		 1245 aa  448  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3234  TonB-dependent receptor plug  33.55 
 
 		 1221 aa  408  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763048  normal  0.0174911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1013  TonB-dependent receptor plug  34.85 
 
 		 1273 aa  403  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2901  TonB-dependent receptor plug  33.73 
 
 		 1134 aa  253  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.269795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1349  TonB-dependent receptor plug  35.13 
 
 		 1232 aa  158  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2048  TonB-dependent receptor  37.97 
 
 		 929 aa  154  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.221244  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4279  TonB-dependent receptor plug  34.6 
 
 		 1153 aa  140  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4266  TonB-dependent receptor plug  38.76 
 
 		 1091 aa  139  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4278  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 1146 aa  133  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4280  TonB-dependent receptor plug  30.98 
 
 		 1144 aa  133  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4287  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 1149 aa  117  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1286  TonB-dependent receptor plug  37.3 
 
 		 978 aa  115  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1267  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 980 aa  105  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1125  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 967 aa  89.7  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304926 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0522  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 817 aa  75.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3521  TonB-dependent siderophore receptor  29.7 
 
 		 699 aa  67.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  29.05 
 
 		 727 aa  67.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  26.45 
 
 		 755 aa  66.2  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  28.11 
 
 		 715 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  28.11 
 
 		 732 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  28.5 
 
 		 694 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  26.05 
 
 		 707 aa  62.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0089  TonB-dependent siderophore receptor  26.22 
 
 		 699 aa  62  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.26085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1440  TonB dependent, hydroxamate-type ferrisiderophore, outer membrane receptor  25.84 
 
 		 699 aa  61.6  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453975  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2131  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 757 aa  61.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0772564  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 732 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3560  TonB-dependent siderophore receptor  32.38 
 
 		 710 aa  60.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  25.57 
 
 		 863 aa  60.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  26.32 
 
 		 745 aa  58.2  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  26.32 
 
 		 747 aa  58.2  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 747 aa  57.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  26.32 
 
 		 747 aa  57.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  23.89 
 
 		 721 aa  58.2  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  31.36 
 
 		 776 aa  58.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  29.26 
 
 		 747 aa  58.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  26.32 
 
 		 747 aa  57.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 		 701 aa  58.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  29.55 
 
 		 735 aa  57.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  26.32 
 
 		 747 aa  57.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3723  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 767 aa  57.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  28.25 
 
 		 751 aa  57.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 710 aa  57  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  26.8 
 
 		 752 aa  57.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 		 753 aa  57.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 696 aa  57  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0947  TonB-dependent siderophore receptor  35.88 
 
 		 683 aa  56.6  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0779656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  23.71 
 
 		 779 aa  56.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  28.05 
 
 		 734 aa  55.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  26.74 
 
 		 747 aa  56.2  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1352  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 832 aa  55.8  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 		 734 aa  55.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  29.31 
 
 		 708 aa  55.5  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  28.05 
 
 		 736 aa  55.5  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  28.93 
 
 		 708 aa  55.5  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  22.42 
 
 		 710 aa  54.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  31.88 
 
 		 711 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  29.53 
 
 		 709 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  22.28 
 
 		 770 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 792 aa  54.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 707 aa  53.5  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 825 aa  53.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1281  TonB-dependent siderophore receptor  27.71 
 
 		 699 aa  53.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 		 727 aa  53.5  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  21.67 
 
 		 701 aa  53.5  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  29.05 
 
 		 724 aa  53.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  22.28 
 
 		 710 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  25.08 
 
 		 723 aa  53.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  28.27 
 
 		 722 aa  53.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3722  TonB-dependent receptor plug  28.49 
 
 		 896 aa  53.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.275954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  25.64 
 
 		 747 aa  53.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5955  TonB-dependent siderophore receptor  26.61 
 
 		 877 aa  53.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0124539 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  20.91 
 
 		 701 aa  52.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  23.69 
 
 		 708 aa  52.8  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  20.91 
 
 		 701 aa  52.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  25.37 
 
 		 733 aa  52.8  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  27.69 
 
 		 850 aa  52.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  29.41 
 
 		 722 aa  52  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  25.79 
 
 		 729 aa  52  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  23.62 
 
 		 703 aa  52  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.22 
 
 		 833 aa  52  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.08 
 
 		 711 aa  52  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.08 
 
 		 706 aa  52  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  25.73 
 
 		 742 aa  52  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0837  TonB-dependent siderophore receptor  24.24 
 
 		 759 aa  52  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213171  normal  0.109269 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  25.73 
 
 		 742 aa  52  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  25.44 
 
 		 738 aa  52  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  25.7 
 
 		 825 aa  51.6  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 		 730 aa  51.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  26.54 
 
 		 709 aa  51.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>