More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2317 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2317  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1202 aa  2447    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3766  TonB-dependent receptor plug  35.36 
 
 		 1146 aa  609  1e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0596  TonB-dependent receptor plug  34.93 
 
 		 1245 aa  610  1e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0600  TonB-dependent receptor plug  33.53 
 
 		 1294 aa  591  1e-167  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1991  TonB-dependent receptor plug  34.35 
 
 		 1243 aa  585  1.0000000000000001e-165  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302175  normal  0.112109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1754  TonB-dependent receptor plug  34.74 
 
 		 1243 aa  561  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3377  TonB-dependent receptor plug  34.56 
 
 		 1314 aa  551  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615766  normal  0.66786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1013  TonB-dependent receptor plug  33.06 
 
 		 1273 aa  536  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2495  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 1247 aa  516  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2928  TonB-dependent receptor plug  32.67 
 
 		 1245 aa  507  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3234  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1221 aa  448  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763048  normal  0.0174911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1794  TonB-dependent receptor plug  38.33 
 
 		 1302 aa  382  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1755  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 1289 aa  293  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4266  TonB-dependent receptor plug  26.08 
 
 		 1091 aa  286  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3199  TonB-dependent receptor plug  50.69 
 
 		 1297 aa  261  4e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2901  TonB-dependent receptor plug  36.57 
 
 		 1134 aa  261  6e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.269795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4280  TonB-dependent receptor plug  24.7 
 
 		 1144 aa  241  9e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4287  TonB-dependent receptor plug  25.92 
 
 		 1149 aa  181  8e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1349  TonB-dependent receptor plug  34.88 
 
 		 1232 aa  157  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2048  TonB-dependent receptor  36.46 
 
 		 929 aa  152  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.221244  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4279  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 1153 aa  144  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4278  TonB-dependent receptor plug  26.56 
 
 		 1146 aa  136  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1267  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 980 aa  125  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1286  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 978 aa  111  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1281  TonB-dependent siderophore receptor  31.43 
 
 		 699 aa  82  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0522  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 817 aa  80.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1125  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 967 aa  79  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304926 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  31.03 
 
 		 727 aa  75.9  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  29.91 
 
 		 755 aa  75.5  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 		 701 aa  72  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  30.2 
 
 		 719 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3085  TonB-dependent siderophore receptor  28.7 
 
 		 767 aa  70.1  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal  0.216415 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  28.84 
 
 		 689 aa  69.7  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0837  TonB-dependent siderophore receptor  27.88 
 
 		 759 aa  69.3  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213171  normal  0.109269 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3723  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 767 aa  68.9  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  28.69 
 
 		 708 aa  68.2  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1826  TonB-dependent siderophore receptor  25.71 
 
 		 784 aa  67  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3047  TonB-dependent siderophore receptor  28.26 
 
 		 737 aa  67  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  31.84 
 
 		 735 aa  67  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1352  TonB-dependent receptor plug  25.82 
 
 		 832 aa  66.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 		 710 aa  66.2  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  28.26 
 
 		 703 aa  66.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  28.7 
 
 		 715 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5897  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 705 aa  65.9  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  26.49 
 
 		 770 aa  65.1  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  26.87 
 
 		 716 aa  65.1  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  26.49 
 
 		 710 aa  65.1  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3505  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 830 aa  64.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  26.2 
 
 		 742 aa  64.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  27.73 
 
 		 707 aa  64.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 701 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3722  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 896 aa  64.3  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.275954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  25.65 
 
 		 712 aa  64.3  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  22.9 
 
 		 732 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  28.94 
 
 		 718 aa  64.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  22.43 
 
 		 732 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2558  TonB-dependent siderophore receptor  27.4 
 
 		 760 aa  64.3  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.897783  normal  0.0361628 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  26.2 
 
 		 742 aa  64.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2131  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 		 757 aa  63.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0772564  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 		 710 aa  63.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  27.73 
 
 		 708 aa  63.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  24.36 
 
 		 745 aa  63.2  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 		 753 aa  62.8  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  27.54 
 
 		 722 aa  62.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  28.45 
 
 		 778 aa  62.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  28.97 
 
 		 694 aa  62.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  26.2 
 
 		 741 aa  62.8  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  27.11 
 
 		 714 aa  62.4  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1808  TonB-dependent siderophore receptor  30.38 
 
 		 739 aa  62.4  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  25.86 
 
 		 701 aa  62.4  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  25.86 
 
 		 701 aa  62.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  24.81 
 
 		 701 aa  62  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  27.98 
 
 		 711 aa  62  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  24.44 
 
 		 719 aa  61.6  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  24.81 
 
 		 701 aa  61.6  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  23.81 
 
 		 734 aa  61.6  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  24.81 
 
 		 701 aa  61.6  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 730 aa  61.6  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  31.68 
 
 		 821 aa  61.6  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 		 709 aa  60.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  24.69 
 
 		 733 aa  61.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  24.79 
 
 		 721 aa  61.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 		 860 aa  61.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  26.38 
 
 		 743 aa  60.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  24.91 
 
 		 843 aa  60.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  24.03 
 
 		 726 aa  60.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  29.94 
 
 		 792 aa  60.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1139  TonB-dependent siderophore receptor  27.66 
 
 		 736 aa  60.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.489697 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  24.8 
 
 		 719 aa  60.1  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.27 
 
 		 711 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 		 794 aa  59.7  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  24.73 
 
 		 747 aa  59.7  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  23.48 
 
 		 723 aa  59.7  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  25.5 
 
 		 729 aa  59.7  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  25 
 
 		 729 aa  59.7  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.31 
 
 		 709 aa  59.3  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 		 710 aa  59.3  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  28.48 
 
 		 726 aa  59.3  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0238  TonB-dependent siderophore receptor  26.18 
 
 		 777 aa  59.3  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0584339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  23.9 
 
 		 734 aa  59.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>