278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4278 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4280  TonB-dependent receptor plug  57.14 
 
 		 1144 aa  1295    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4278  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1146 aa  2348    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4287  TonB-dependent receptor plug  49.48 
 
 		 1149 aa  1033    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4279  TonB-dependent receptor plug  54.17 
 
 		 1153 aa  1195    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4266  TonB-dependent receptor plug  34.92 
 
 		 1091 aa  560  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1349  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 1232 aa  237  8e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3766  TonB-dependent receptor plug  24.86 
 
 		 1146 aa  232  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0596  TonB-dependent receptor plug  23.98 
 
 		 1245 aa  210  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1794  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 		 1302 aa  177  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2928  TonB-dependent receptor plug  24.22 
 
 		 1245 aa  171  8e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2495  TonB-dependent receptor plug  29.53 
 
 		 1247 aa  167  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3234  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 1221 aa  155  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763048  normal  0.0174911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3377  TonB-dependent receptor plug  33.64 
 
 		 1314 aa  152  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615766  normal  0.66786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1991  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 1243 aa  147  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302175  normal  0.112109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0600  TonB-dependent receptor plug  32.21 
 
 		 1294 aa  144  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2317  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 		 1202 aa  143  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1013  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 		 1273 aa  140  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1755  TonB-dependent receptor plug  30.55 
 
 		 1289 aa  137  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3199  TonB-dependent receptor plug  30.07 
 
 		 1297 aa  129  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2901  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1134 aa  129  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.269795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1754  TonB-dependent receptor plug  30.59 
 
 		 1243 aa  126  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2048  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 929 aa  119  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.221244  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0522  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 817 aa  86.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1286  TonB-dependent receptor plug  33.16 
 
 		 978 aa  82  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1267  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 980 aa  80.9  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 755 aa  73.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  24.66 
 
 		 723 aa  67  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1125  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 967 aa  64.3  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304926 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  24.24 
 
 		 737 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3722  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 896 aa  63.9  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.275954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  24.03 
 
 		 703 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  24.76 
 
 		 708 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  24.24 
 
 		 753 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  24.24 
 
 		 741 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  24.24 
 
 		 752 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  24.24 
 
 		 753 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  25.19 
 
 		 738 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  24.24 
 
 		 736 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0514  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 768 aa  63.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400369  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  24.24 
 
 		 736 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3723  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 		 767 aa  62  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0530  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 767 aa  61.6  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.898854  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2131  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 757 aa  61.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0772564  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3330  hypothetical protein  26.41 
 
 		 714 aa  60.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.641382  normal  0.572781 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  26.05 
 
 		 722 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  23.25 
 
 		 745 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 		 771 aa  60.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  27.76 
 
 		 725 aa  59.7  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003567  ferrichrome-iron receptor  24.69 
 
 		 740 aa  59.7  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 757 aa  59.3  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2275  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 779 aa  59.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00175316  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0540  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 718 aa  59.3  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  24.77 
 
 		 709 aa  59.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  38.54 
 
 		 699 aa  58.9  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3521  TonB-dependent siderophore receptor  25.76 
 
 		 699 aa  58.9  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  23.61 
 
 		 815 aa  58.9  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 		 735 aa  58.2  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0311  TonB-dependent siderophore receptor  26.2 
 
 		 697 aa  57.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000107098  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  27.33 
 
 		 736 aa  57  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2846  TonB-dependent siderophore receptor, putative  23.62 
 
 		 728 aa  57  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306235  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  26.77 
 
 		 712 aa  57.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  27.33 
 
 		 734 aa  57.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 722 aa  57  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  26.89 
 
 		 703 aa  56.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1440  TonB dependent, hydroxamate-type ferrisiderophore, outer membrane receptor  23.19 
 
 		 699 aa  56.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453975  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0603  TonB-dependent siderophore receptor  31.02 
 
 		 716 aa  56.2  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00298801  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 747 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 722 aa  56.2  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  26.62 
 
 		 801 aa  56.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 		 734 aa  55.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1352  TonB-dependent receptor plug  27.62 
 
 		 832 aa  56.2  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  22.47 
 
 		 729 aa  55.5  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0089  TonB-dependent siderophore receptor  23.19 
 
 		 699 aa  55.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.26085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  24.63 
 
 		 692 aa  55.5  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1823  TonB-dependent siderophore receptor  30.57 
 
 		 696 aa  55.5  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.077851  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  22.47 
 
 		 729 aa  55.1  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  27.98 
 
 		 833 aa  55.5  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  22.47 
 
 		 729 aa  55.1  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  25.19 
 
 		 720 aa  55.1  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  22.47 
 
 		 729 aa  55.1  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  22.47 
 
 		 729 aa  55.5  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  22.47 
 
 		 729 aa  55.1  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  22.47 
 
 		 729 aa  55.5  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  25.87 
 
 		 748 aa  55.1  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 		 710 aa  55.1  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03559  putative outer membrane receptor for iron transport  23.02 
 
 		 761 aa  54.3  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143456  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  26.18 
 
 		 701 aa  54.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  24.76 
 
 		 808 aa  54.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0837  TonB-dependent siderophore receptor  28.75 
 
 		 759 aa  54.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213171  normal  0.109269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 802 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  29.55 
 
 		 745 aa  54.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  26.13 
 
 		 745 aa  53.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.29 
 
 		 703 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  22.18 
 
 		 721 aa  53.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  24.04 
 
 		 743 aa  53.5  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  25.36 
 
 		 821 aa  53.5  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  30.56 
 
 		 754 aa  53.5  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  26.55 
 
 		 828 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  22.19 
 
 		 729 aa  53.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  21.49 
 
 		 742 aa  53.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>