More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3330 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4755  TonB-dependent siderophore receptor  56.77 
 
 		 797 aa  818    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.251254  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3417  TonB dependent outer membrane ferrichrome-iron receptor  80.56 
 
 		 715 aa  1152    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4624  TonB-dependent siderophore receptor  58.51 
 
 		 797 aa  822    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185618  decreased coverage  0.0000000123032 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3062  TonB-dependent siderophore receptor  80.84 
 
 		 715 aa  1159    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.173013 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3640  TonB-dependent siderophore receptor  54.24 
 
 		 708 aa  793    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168279  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3330  hypothetical protein  100 
 
 		 714 aa  1450    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.641382  normal  0.572781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4761  TonB-dependent siderophore receptor  56.71 
 
 		 797 aa  820    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3521  TonB-dependent siderophore receptor  47.67 
 
 		 699 aa  624  1e-177  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  36.89 
 
 		 718 aa  402  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6718  ferrichrome receptor precursor protein  31.92 
 
 		 719 aa  273  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  31.28 
 
 		 829 aa  271  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  30.64 
 
 		 733 aa  269  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  31.34 
 
 		 778 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  31.68 
 
 		 817 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  31.2 
 
 		 745 aa  266  8e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  29.15 
 
 		 723 aa  265  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  31.02 
 
 		 706 aa  265  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  31.72 
 
 		 799 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  30.01 
 
 		 829 aa  263  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  30.38 
 
 		 740 aa  261  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  29.96 
 
 		 745 aa  261  5.0000000000000005e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  30.24 
 
 		 799 aa  259  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  31.01 
 
 		 821 aa  258  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  31.21 
 
 		 719 aa  259  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  32.07 
 
 		 791 aa  258  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  29.37 
 
 		 806 aa  256  9e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  31.96 
 
 		 791 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  31.15 
 
 		 724 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  31.19 
 
 		 727 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  29.08 
 
 		 729 aa  253  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 820 aa  253  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  29.21 
 
 		 729 aa  252  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  29.3 
 
 		 735 aa  251  4e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  29.1 
 
 		 799 aa  251  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 794 aa  250  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  28.03 
 
 		 797 aa  250  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  30.93 
 
 		 696 aa  250  7e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 		 699 aa  250  8e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  29.51 
 
 		 808 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  29.56 
 
 		 863 aa  249  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001284  putative iron(III) compound receptor  28.02 
 
 		 701 aa  249  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000165675  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  29.82 
 
 		 717 aa  248  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3585  ferrichrome receptor precursor protein  30.39 
 
 		 718 aa  248  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.885271  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1139  TonB-dependent siderophore receptor  29.63 
 
 		 736 aa  246  8e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.489697 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  29.49 
 
 		 729 aa  246  9e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  29.13 
 
 		 703 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  29.13 
 
 		 703 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2875  outer membrane protein  29.91 
 
 		 733 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.917114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  30.21 
 
 		 806 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  28.44 
 
 		 729 aa  246  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1440  TonB dependent, hydroxamate-type ferrisiderophore, outer membrane receptor  31.35 
 
 		 699 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453975  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.62 
 
 		 833 aa  245  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 		 797 aa  244  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  30.85 
 
 		 728 aa  244  5e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 734 aa  243  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  31.56 
 
 		 819 aa  243  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  28.3 
 
 		 797 aa  243  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0089  TonB-dependent siderophore receptor  31.03 
 
 		 699 aa  242  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.26085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  29.21 
 
 		 729 aa  242  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  31.21 
 
 		 744 aa  242  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  27.97 
 
 		 753 aa  241  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  28.35 
 
 		 747 aa  240  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 828 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2192  ferrioxamine B receptor precursor protein  28.88 
 
 		 724 aa  239  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  decreased coverage  0.00773577 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  30.78 
 
 		 744 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  27.85 
 
 		 714 aa  237  6e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  30.14 
 
 		 701 aa  237  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  30.31 
 
 		 812 aa  237  7e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0672  TonB-dependent siderophore receptor  30.25 
 
 		 728 aa  236  8e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264811  normal  0.669281 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0646  TonB-dependent siderophore receptor  30.33 
 
 		 665 aa  236  8e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123915  normal  0.553141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  27.15 
 
 		 828 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3474  ferrichrome receptor precursor protein  28.59 
 
 		 719 aa  236  9e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.588367  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  30.85 
 
 		 822 aa  236  9e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 		 750 aa  236  9e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  29.35 
 
 		 801 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  28.22 
 
 		 747 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  30.47 
 
 		 757 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  27.48 
 
 		 810 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  30.1 
 
 		 717 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4135  ferrioxamine B receptor precursor protein  27.72 
 
 		 726 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156472  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  30.21 
 
 		 717 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  27.15 
 
 		 828 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1541  TonB-dependent siderophore receptor  27.82 
 
 		 750 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0957373  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2580  iron(III) compound receptor  28.19 
 
 		 718 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000113666  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  28.07 
 
 		 747 aa  234  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0683  TonB-dependent siderophore receptor  30.1 
 
 		 728 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  28.07 
 
 		 747 aa  234  5e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  28.06 
 
 		 747 aa  234  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2399  TonB-dependent siderophore receptor  28.15 
 
 		 729 aa  234  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 769 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  27.98 
 
 		 808 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  28.3 
 
 		 745 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 696 aa  233  8.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 		 771 aa  233  9e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  29.67 
 
 		 771 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5955  TonB-dependent siderophore receptor  28.33 
 
 		 877 aa  232  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0124539 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1619  TonB-dependent siderophore receptor  28.26 
 
 		 754 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285071 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4790  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 750 aa  231  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1164  TonB-dependent siderophore receptor  28.26 
 
 		 754 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0408687  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1644  TonB-dependent siderophore receptor  28.26 
 
 		 754 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>