241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1349 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1349  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1232 aa  2526    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4280  TonB-dependent receptor plug  31.24 
 
 		 1144 aa  488  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4279  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 1153 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4287  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 1149 aa  274  7e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4278  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 1146 aa  237  9e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4266  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 1091 aa  218  4e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0600  TonB-dependent receptor plug  28.59 
 
 		 1294 aa  184  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2495  TonB-dependent receptor plug  37.75 
 
 		 1247 aa  184  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0596  TonB-dependent receptor plug  34.92 
 
 		 1245 aa  180  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1013  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 1273 aa  174  7.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3766  TonB-dependent receptor plug  25.78 
 
 		 1146 aa  171  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3377  TonB-dependent receptor plug  33.73 
 
 		 1314 aa  171  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615766  normal  0.66786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1991  TonB-dependent receptor plug  35.89 
 
 		 1243 aa  167  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302175  normal  0.112109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3234  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 1221 aa  166  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763048  normal  0.0174911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1755  TonB-dependent receptor plug  34.55 
 
 		 1289 aa  164  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2317  TonB-dependent receptor plug  34.53 
 
 		 1202 aa  162  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2901  TonB-dependent receptor plug  32.85 
 
 		 1134 aa  160  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.269795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2928  TonB-dependent receptor plug  35.03 
 
 		 1245 aa  160  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1794  TonB-dependent receptor plug  35.27 
 
 		 1302 aa  158  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1754  TonB-dependent receptor plug  35.13 
 
 		 1243 aa  153  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2048  TonB-dependent receptor  34.49 
 
 		 929 aa  140  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.221244  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3199  TonB-dependent receptor plug  32.99 
 
 		 1297 aa  140  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1286  TonB-dependent receptor plug  38.59 
 
 		 978 aa  105  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1267  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 980 aa  87.8  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1125  TonB-dependent receptor plug  27.76 
 
 		 967 aa  87.8  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304926 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2399  TonB-dependent siderophore receptor  29.15 
 
 		 729 aa  71.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  32.3 
 
 		 738 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  34.64 
 
 		 741 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  34.64 
 
 		 737 aa  70.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  34.64 
 
 		 736 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  34.64 
 
 		 752 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  34.64 
 
 		 753 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  34.64 
 
 		 753 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  34.64 
 
 		 736 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1562  TonB-dependent siderophore receptor  29.38 
 
 		 753 aa  65.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000416689  normal  0.182143 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  29.89 
 
 		 745 aa  65.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7174  TonB-dependent siderophore receptor  29.57 
 
 		 729 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.229498 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  24.52 
 
 		 860 aa  64.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  27.83 
 
 		 748 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 789 aa  62.4  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6529  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 		 725 aa  62  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180795  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6763  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 		 725 aa  62  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3722  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 896 aa  62  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.275954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0522  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 817 aa  62  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  29.89 
 
 		 734 aa  61.6  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1541  TonB-dependent siderophore receptor  29.06 
 
 		 750 aa  61.6  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0957373  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  26.79 
 
 		 801 aa  61.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  22.25 
 
 		 753 aa  60.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6351  TonB-dependent siderophore receptor  28.83 
 
 		 725 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532557  normal  0.487523 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4790  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 		 750 aa  59.3  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1164  TonB-dependent siderophore receptor  29.31 
 
 		 754 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0408687  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1644  TonB-dependent siderophore receptor  29.31 
 
 		 754 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107171  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 		 727 aa  59.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1619  TonB-dependent siderophore receptor  29.31 
 
 		 754 aa  59.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285071 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  26.22 
 
 		 709 aa  58.5  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  25.25 
 
 		 723 aa  57.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  27.61 
 
 		 819 aa  57.4  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  27.95 
 
 		 708 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4066  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 		 785 aa  57.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 		 701 aa  58.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0089  TonB-dependent siderophore receptor  25.44 
 
 		 699 aa  57.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.26085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1440  TonB dependent, hydroxamate-type ferrisiderophore, outer membrane receptor  26.05 
 
 		 699 aa  57.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453975  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 		 708 aa  57  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1139  TonB-dependent siderophore receptor  24.14 
 
 		 736 aa  57.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.489697 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  27.37 
 
 		 755 aa  56.6  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  28.28 
 
 		 735 aa  56.2  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  25.6 
 
 		 779 aa  55.8  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6070  TonB-dependent siderophore receptor  28.11 
 
 		 729 aa  55.5  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6367  TonB-dependent siderophore receptor  32.03 
 
 		 729 aa  55.5  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0338  ferrioxamine B receptor precursor protein  26.77 
 
 		 705 aa  55.5  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.203857  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  34.48 
 
 		 743 aa  55.1  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  23.28 
 
 		 833 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1474  TonB-dependent siderophore receptor  28.26 
 
 		 715 aa  54.3  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  26.63 
 
 		 711 aa  54.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1006  TonB-dependent siderophore receptor  26.34 
 
 		 726 aa  54.3  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  24.57 
 
 		 745 aa  54.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  25.76 
 
 		 708 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  24.6 
 
 		 806 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0947  TonB-dependent siderophore receptor  30.66 
 
 		 683 aa  54.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0779656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 766 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  30.67 
 
 		 733 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  27.17 
 
 		 831 aa  53.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  25.27 
 
 		 821 aa  53.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4602  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 		 784 aa  53.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4121  TonB-dependent siderophore receptor  27.33 
 
 		 785 aa  53.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.922703 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 		 829 aa  53.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4489  TonB-dependent siderophore receptor  27.33 
 
 		 785 aa  53.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  22.99 
 
 		 721 aa  52.8  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 		 708 aa  52.8  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1281  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 699 aa  52.8  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  24.48 
 
 		 703 aa  52.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  25.7 
 
 		 711 aa  52.8  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  24.52 
 
 		 708 aa  52.8  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  26.89 
 
 		 844 aa  52.4  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 		 808 aa  52.4  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  24.14 
 
 		 717 aa  52  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  26.25 
 
 		 715 aa  52  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1676  TonB-dependent siderophore receptor  28.48 
 
 		 757 aa  52  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 794 aa  52  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  24.14 
 
 		 717 aa  51.6  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>