28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3367 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1102  TonB-dependent receptor domain-containing protein  64.33 
 
 		 683 aa  868    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3439  TonB-dependent receptor  97.22 
 
 		 684 aa  1345    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.587459  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0939  TonB-dependent receptor  67.11 
 
 		 683 aa  945    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0878917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0923  TonB-dependent receptor  98.1 
 
 		 684 aa  1385    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.854225  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0937  TonB-dependent receptor  65.94 
 
 		 683 aa  914    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3564  TonB-dependent receptor  96.2 
 
 		 684 aa  1329    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000148134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0973  TonB-dependent receptor  65.94 
 
 		 683 aa  913    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00145441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0935  TonB-dependent receptor  66.23 
 
 		 683 aa  914    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000201333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3367  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 684 aa  1410    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0948  TonB-dependent receptor domain-containing protein  39.19 
 
 		 691 aa  492  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.915378  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  27.27 
 
 		 737 aa  195  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 730 aa  180  9e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 727 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 727 aa  177  7e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 751 aa  177  9e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 729 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 734 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2540  hypothetical protein  24.34 
 
 		 601 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.600129  normal  0.687458 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 738 aa  122  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4270  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 880 aa  103  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.156647  decreased coverage  0.00504276 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0508  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 764 aa  94.4  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.786517  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0023  TonB-dependent receptor  22.14 
 
 		 747 aa  86.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  20.62 
 
 		 773 aa  80.1  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  21.78 
 
 		 717 aa  50.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 697 aa  48.1  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 		 781 aa  48.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 809 aa  45.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  25.55 
 
 		 666 aa  45.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>