More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0445 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 734 aa  1514    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  34.49 
 
 		 738 aa  428  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  36.15 
 
 		 727 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  38.3 
 
 		 730 aa  422  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  36.02 
 
 		 727 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  36.53 
 
 		 737 aa  415  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  36.59 
 
 		 729 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  36.19 
 
 		 751 aa  403  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0023  TonB-dependent receptor  35.9 
 
 		 747 aa  374  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  36.14 
 
 		 773 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4270  TonB-dependent receptor  35.09 
 
 		 880 aa  355  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.156647  decreased coverage  0.00504276 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0508  TonB-dependent receptor  32.36 
 
 		 764 aa  341  2.9999999999999998e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.786517  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 782 aa  192  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 700 aa  164  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  26.92 
 
 		 705 aa  164  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 709 aa  157  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  24.31 
 
 		 731 aa  143  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  25.2 
 
 		 703 aa  138  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0923  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 684 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.854225  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3564  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 684 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000148134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3367  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 684 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  24.14 
 
 		 712 aa  127  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3439  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 684 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.587459  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  29.91 
 
 		 518 aa  126  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0937  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 683 aa  125  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  24.01 
 
 		 710 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  25.44 
 
 		 690 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  24.72 
 
 		 711 aa  120  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  26.05 
 
 		 687 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0973  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 683 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00145441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0935  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 683 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000201333  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1102  TonB-dependent receptor domain-containing protein  24.23 
 
 		 683 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0939  TonB-dependent receptor  21.17 
 
 		 683 aa  111  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0878917  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  23.32 
 
 		 807 aa  107  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0948  TonB-dependent receptor domain-containing protein  21.18 
 
 		 691 aa  103  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.915378  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 821 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  23.32 
 
 		 774 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  30.58 
 
 		 704 aa  97.8  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  32.6 
 
 		 688 aa  94.4  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  30.43 
 
 		 696 aa  91.3  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  22.54 
 
 		 713 aa  90.5  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  34.16 
 
 		 675 aa  90.1  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 721 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  24.32 
 
 		 724 aa  88.6  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  23.54 
 
 		 724 aa  88.2  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  24.63 
 
 		 693 aa  87.4  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  24.09 
 
 		 710 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  33.16 
 
 		 721 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  25.15 
 
 		 799 aa  85.9  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  22.87 
 
 		 723 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 715 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  24.68 
 
 		 703 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  26.05 
 
 		 709 aa  83.2  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  23.11 
 
 		 702 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  23.11 
 
 		 702 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 		 708 aa  82.4  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 723 aa  82.4  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  23.26 
 
 		 784 aa  82  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 715 aa  81.3  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4665  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 739 aa  80.9  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  23.74 
 
 		 706 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3037  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 736 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117014 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  32.26 
 
 		 809 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0833  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 411 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0977  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 411 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  23.74 
 
 		 706 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  23.74 
 
 		 706 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  23.74 
 
 		 721 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  29.31 
 
 		 717 aa  78.6  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  22.15 
 
 		 708 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  21.56 
 
 		 695 aa  77.8  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  24.28 
 
 		 720 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  23.6 
 
 		 706 aa  77.4  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  24.48 
 
 		 708 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  31.43 
 
 		 720 aa  75.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  29.17 
 
 		 809 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  24.01 
 
 		 720 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 		 809 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  29.34 
 
 		 809 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  22.66 
 
 		 710 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6744  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 731 aa  74.7  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.468719 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  24.29 
 
 		 705 aa  73.9  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  24.41 
 
 		 720 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  23.72 
 
 		 720 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1811  diaminopimelate epimerase (DAP epimerase)  23.42 
 
 		 330 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  28.21 
 
 		 782 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 777 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  23.15 
 
 		 714 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  20.71 
 
 		 722 aa  72.8  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  24.33 
 
 		 730 aa  72.4  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  29.05 
 
 		 784 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  28.38 
 
 		 784 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  31.97 
 
 		 774 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  31.97 
 
 		 774 aa  71.6  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  31.97 
 
 		 774 aa  71.6  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  31.97 
 
 		 774 aa  71.6  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  22.67 
 
 		 757 aa  71.2  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 		 782 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  28.48 
 
 		 731 aa  71.2  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  32.58 
 
 		 774 aa  71.2  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>