26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0923 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3564  TonB-dependent receptor  97.22 
 
 		 684 aa  1342    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000148134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0935  TonB-dependent receptor  67.4 
 
 		 683 aa  929    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000201333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0973  TonB-dependent receptor  67.11 
 
 		 683 aa  928    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00145441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3367  TonB-dependent receptor  98.1 
 
 		 684 aa  1385    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0937  TonB-dependent receptor  66.96 
 
 		 683 aa  928    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3439  TonB-dependent receptor  98.25 
 
 		 684 aa  1385    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.587459  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1102  TonB-dependent receptor domain-containing protein  65.5 
 
 		 683 aa  884    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0923  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 684 aa  1408    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.854225  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0939  TonB-dependent receptor  68.27 
 
 		 683 aa  957    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0878917  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0948  TonB-dependent receptor domain-containing protein  39.77 
 
 		 691 aa  501  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.915378  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  28.07 
 
 		 737 aa  189  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 730 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 727 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 727 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 751 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 729 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 734 aa  143  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2540  hypothetical protein  24.34 
 
 		 601 aa  128  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.600129  normal  0.687458 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 738 aa  126  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0508  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 764 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.786517  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4270  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 880 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.156647  decreased coverage  0.00504276 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0023  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 		 747 aa  94.7  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  21 
 
 		 773 aa  84.3  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  21.18 
 
 		 697 aa  47  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 781 aa  47.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  22.36 
 
 		 717 aa  43.9  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>