28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3564 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3439  TonB-dependent receptor  96.2 
 
 		 684 aa  1330    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.587459  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3367  TonB-dependent receptor  96.2 
 
 		 684 aa  1329    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0939  TonB-dependent receptor  68.13 
 
 		 683 aa  950    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0878917  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0935  TonB-dependent receptor  67.25 
 
 		 683 aa  924    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000201333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0973  TonB-dependent receptor  67.11 
 
 		 683 aa  924    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00145441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0923  TonB-dependent receptor  97.22 
 
 		 684 aa  1342    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.854225  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1102  TonB-dependent receptor domain-containing protein  64.47 
 
 		 683 aa  867    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3564  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 684 aa  1408    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000148134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0937  TonB-dependent receptor  66.67 
 
 		 683 aa  920    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0948  TonB-dependent receptor domain-containing protein  39.86 
 
 		 691 aa  503  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.915378  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  28.07 
 
 		 737 aa  190  9e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 727 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 730 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 727 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 751 aa  173  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 729 aa  169  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 734 aa  140  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2540  hypothetical protein  23.37 
 
 		 601 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.600129  normal  0.687458 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 738 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0508  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 764 aa  106  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.786517  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0023  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 747 aa  97.8  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4270  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 880 aa  97.4  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.156647  decreased coverage  0.00504276 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  21.58 
 
 		 773 aa  88.6  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  20.41 
 
 		 708 aa  48.1  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  22.1 
 
 		 717 aa  47.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 781 aa  47  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  21.4 
 
 		 697 aa  45.8  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  21.88 
 
 		 695 aa  45.1  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>