26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1102 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3439  TonB-dependent receptor  64.62 
 
 		 684 aa  902    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.587459  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3367  TonB-dependent receptor  64.33 
 
 		 684 aa  895    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0939  TonB-dependent receptor  66.91 
 
 		 683 aa  952    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0878917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0923  TonB-dependent receptor  65.5 
 
 		 684 aa  912    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.854225  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0935  TonB-dependent receptor  84.33 
 
 		 683 aa  1161    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000201333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0973  TonB-dependent receptor  84.33 
 
 		 683 aa  1163    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00145441  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1102  TonB-dependent receptor domain-containing protein  100 
 
 		 683 aa  1405    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3564  TonB-dependent receptor  64.47 
 
 		 684 aa  895    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000148134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0937  TonB-dependent receptor  85.07 
 
 		 683 aa  1174    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0948  TonB-dependent receptor domain-containing protein  36.19 
 
 		 691 aa  464  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.915378  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 751 aa  181  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  25.22 
 
 		 737 aa  179  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 730 aa  179  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 729 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 727 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 727 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 734 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2540  hypothetical protein  24.51 
 
 		 601 aa  124  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.600129  normal  0.687458 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 738 aa  120  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4270  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 880 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.156647  decreased coverage  0.00504276 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  21.91 
 
 		 773 aa  95.5  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0508  TonB-dependent receptor  22.25 
 
 		 764 aa  92  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.786517  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0023  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 747 aa  84  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 634 aa  54.7  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  21.01 
 
 		 731 aa  50.1  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  20.93 
 
 		 697 aa  47.4  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>