More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0118 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0118  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 633 aa  1266    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 656 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 665 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  24.21 
 
 		 656 aa  106  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  21.47 
 
 		 713 aa  104  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 652 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 644 aa  102  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  23.7 
 
 		 659 aa  102  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  23.73 
 
 		 653 aa  101  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2631  TonB-dependent receptor domain-containing protein  24.76 
 
 		 646 aa  100  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221793  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  24.17 
 
 		 653 aa  98.2  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 653 aa  97.1  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 704 aa  97.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  23.86 
 
 		 653 aa  97.1  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2625  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 657 aa  95.1  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980205  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  23.91 
 
 		 653 aa  94  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 653 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 653 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  23.63 
 
 		 653 aa  90.9  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  23.71 
 
 		 664 aa  90.1  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4390  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 704 aa  80.5  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 		 688 aa  78.6  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2309  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  23.61 
 
 		 666 aa  78.2  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2666  TonB-dependent receptor  20.9 
 
 		 638 aa  75.1  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 656 aa  75.5  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  22.45 
 
 		 690 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 694 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  20.18 
 
 		 630 aa  67  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  20.08 
 
 		 628 aa  67  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  21.97 
 
 		 688 aa  66.6  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  30.32 
 
 		 664 aa  65.5  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  19.79 
 
 		 675 aa  63.9  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  22.66 
 
 		 740 aa  63.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 742 aa  63.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  22.4 
 
 		 651 aa  62  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  22.09 
 
 		 648 aa  61.6  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613844 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  21.88 
 
 		 712 aa  62  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 653 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 974 aa  61.2  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  26.17 
 
 		 827 aa  60.8  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  24.44 
 
 		 631 aa  60.8  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 681 aa  58.2  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 904 aa  57.4  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 904 aa  57.8  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 904 aa  57.8  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  22.4 
 
 		 703 aa  57.4  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  28.18 
 
 		 746 aa  57.4  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  21.75 
 
 		 807 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 737 aa  57.4  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  28.18 
 
 		 746 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  28.18 
 
 		 746 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1064  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 661 aa  57  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00188221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  28.18 
 
 		 746 aa  57  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  28.18 
 
 		 746 aa  57  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 647 aa  57.4  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  28.18 
 
 		 746 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  20.91 
 
 		 640 aa  57.4  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  28.18 
 
 		 746 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 817 aa  56.6  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  28.18 
 
 		 746 aa  57  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 841 aa  57  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 842 aa  56.6  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 904 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  21.3 
 
 		 704 aa  56.2  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 711 aa  55.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2735  TonB-dependent receptor, plug  25.28 
 
 		 650 aa  55.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 720 aa  55.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3043  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 746 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0305175  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  22.75 
 
 		 646 aa  55.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  27.92 
 
 		 640 aa  55.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  20.5 
 
 		 628 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 777 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 966 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 777 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 777 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  22.31 
 
 		 616 aa  55.1  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0635  TonB-dependent receptor, plug  32.06 
 
 		 706 aa  55.1  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  25.81 
 
 		 812 aa  55.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  21.13 
 
 		 706 aa  55.1  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 957 aa  55.1  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 843 aa  54.7  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1485  outer membrane receptor FepA  24.5 
 
 		 777 aa  54.3  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0839984  normal  0.152216 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  26.85 
 
 		 742 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 948 aa  53.9  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  26.97 
 
 		 839 aa  53.9  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  27.7 
 
 		 742 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  26.63 
 
 		 985 aa  53.5  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 927 aa  53.5  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  21.32 
 
 		 618 aa  53.5  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0570  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  23.53 
 
 		 675 aa  53.5  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 928 aa  53.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 938 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  24.49 
 
 		 611 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1720  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 906 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.673092 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  21.17 
 
 		 720 aa  52.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 665 aa  52.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6373  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 906 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470665  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7523  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 825 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322865  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  23.03 
 
 		 746 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1705  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 906 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>