104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2231 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2231  secretin/TonB, short-like protein  100 
 
 		 206 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4836  hypothetical protein  36.51 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3199  secretin/TonB, short-like  34.74 
 
 		 239 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762853  hitchhiker  0.00345438 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55560  hypothetical protein  35.8 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0430636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0479  secretin/TonB, short-like protein  35.63 
 
 		 260 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.084644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3129  secretin/TonB, short-like protein  30.27 
 
 		 251 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.828632  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2211  hypothetical protein  32.81 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1075  hypothetical protein  33.5 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.80044  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2220  Secretin/TonB short domain  27.72 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2100  hypothetical protein  30.88 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.223696  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2215  hypothetical protein  28.7 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.231176 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2204  hypothetical protein  27.98 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268993  normal  0.0685137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2907  secretin/TonB-like protein  29.08 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  48.44 
 
 		 822 aa  59.3  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  41.43 
 
 		 1186 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  50 
 
 		 1188 aa  57.4  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  36.84 
 
 		 817 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2401  TonB-dependent receptor, putative  26.25 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3314  TonB-dependent receptor  43.08 
 
 		 973 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  38.2 
 
 		 812 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  48.33 
 
 		 863 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  36.79 
 
 		 816 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  36.59 
 
 		 799 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  41.1 
 
 		 835 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1881  hypothetical protein  37.5 
 
 		 176 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2977  TonB-dependent receptor, plug  44.44 
 
 		 518 aa  52.8  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826241  normal  0.256941 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  35.8 
 
 		 778 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  40.48 
 
 		 815 aa  52.4  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  36.47 
 
 		 836 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  38.04 
 
 		 897 aa  52.4  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  32.22 
 
 		 787 aa  52  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  35.16 
 
 		 861 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  47.54 
 
 		 829 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 		 795 aa  51.6  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  45 
 
 		 833 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  37.65 
 
 		 821 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  41.94 
 
 		 812 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  39.13 
 
 		 778 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  35.62 
 
 		 806 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2071  hypothetical protein  34.95 
 
 		 176 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  32.61 
 
 		 809 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  40.91 
 
 		 815 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0658  secretin/TonB  41.18 
 
 		 507 aa  48.9  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  37.7 
 
 		 817 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  37.7 
 
 		 808 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  39.68 
 
 		 862 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  38.89 
 
 		 792 aa  48.1  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4761  TonB-dependent siderophore receptor  27.86 
 
 		 797 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  41.27 
 
 		 862 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  41.27 
 
 		 862 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  38.71 
 
 		 804 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  40.62 
 
 		 857 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4401  TonB-dependent receptor  36.05 
 
 		 756 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78723  normal  0.0995472 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  33.71 
 
 		 839 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  41.1 
 
 		 799 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  36.07 
 
 		 808 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  35.9 
 
 		 798 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 844 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  31.71 
 
 		 791 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  31.51 
 
 		 804 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  33.33 
 
 		 799 aa  46.2  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  35.94 
 
 		 807 aa  46.6  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  42.11 
 
 		 811 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  31.71 
 
 		 791 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  35.62 
 
 		 809 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20010  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  33.85 
 
 		 891 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0486368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  34.41 
 
 		 789 aa  45.4  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  44.93 
 
 		 819 aa  45.1  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  36.36 
 
 		 856 aa  45.1  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2303  TonB-dependent receptor  43.64 
 
 		 982 aa  44.7  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243733  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3810  TonB-dependent receptor plug  35.62 
 
 		 934 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0593009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 809 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  32.88 
 
 		 809 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2531  TonB-dependent receptor  38.55 
 
 		 843 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  37.33 
 
 		 802 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  30.67 
 
 		 804 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  42.19 
 
 		 867 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4624  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 797 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185618  decreased coverage  0.0000000123032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  37.31 
 
 		 804 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  30.86 
 
 		 809 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  29.27 
 
 		 828 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  41.38 
 
 		 864 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  32.39 
 
 		 824 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  34.67 
 
 		 1074 aa  43.5  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  34.78 
 
 		 810 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2236  TonB-dependent receptor, putative  34.12 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313824  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  31.51 
 
 		 809 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1720  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  32.31 
 
 		 885 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95463  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  34.85 
 
 		 808 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 810 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  32.93 
 
 		 794 aa  42.4  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  38.82 
 
 		 793 aa  42.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0725  TonB-dependent receptor protein  40 
 
 		 633 aa  42.4  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  32.84 
 
 		 807 aa  42.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  39.34 
 
 		 810 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  35.21 
 
 		 851 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  39.34 
 
 		 810 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2679  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 1054 aa  42  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  35.21 
 
 		 801 aa  42  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  35.59 
 
 		 864 aa  42  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>