14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2236 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2236  TonB-dependent receptor, putative  100 
 
 		 220 aa  428  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313824  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2568  TonB-dependent receptor, putative  46.05 
 
 		 197 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0359  TonB-dependent receptor, putative  40.67 
 
 		 222 aa  92.8  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0337696 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1461  TonB-dependent receptor, putative  34.63 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2607  hypothetical protein  31 
 
 		 244 aa  86.7  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2401  TonB-dependent receptor, putative  32.44 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2107  TonB-like protein  31.41 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.799306  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4815  hypothetical protein  36.23 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55330  hypothetical protein  36.23 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046002 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2223  hypothetical protein  36.55 
 
 		 247 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.692073  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2990  hypothetical protein  29.56 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181047  normal  0.0324897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2917  hypothetical protein  37.65 
 
 		 247 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2197  hypothetical protein  29.71 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2500  TonB-like  32.88 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>