16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0359 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0359  TonB-dependent receptor, putative  100 
 
 		 222 aa  434  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0337696 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2568  TonB-dependent receptor, putative  55.19 
 
 		 197 aa  158  8e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2401  TonB-dependent receptor, putative  33.77 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2990  hypothetical protein  36.96 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181047  normal  0.0324897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2223  hypothetical protein  38.1 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.692073  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2917  hypothetical protein  36.56 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1461  TonB-dependent receptor, putative  29.39 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2607  hypothetical protein  25.86 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2236  TonB-dependent receptor, putative  35.79 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313824  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4815  hypothetical protein  35.62 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4836  hypothetical protein  35.06 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55330  hypothetical protein  31.51 
 
 		 248 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046002 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55560  hypothetical protein  33.77 
 
 		 238 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0430636 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2100  hypothetical protein  30.4 
 
 		 276 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.223696  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1075  hypothetical protein  36.21 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.80044  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1098  hypothetical protein  45.61 
 
 		 160 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.732446  normal  0.0769565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>