12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2990 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2990  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  467  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181047  normal  0.0324897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2223  hypothetical protein  55.88 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.692073  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2917  hypothetical protein  51.9 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2568  TonB-dependent receptor, putative  40.29 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0359  TonB-dependent receptor, putative  35.51 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0337696 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2401  TonB-dependent receptor, putative  31.16 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2215  hypothetical protein  40.22 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.231176 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2500  TonB-like  29.49 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2907  secretin/TonB-like protein  29.85 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2197  hypothetical protein  27.47 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1461  TonB-dependent receptor, putative  30.17 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2607  hypothetical protein  25 
 
 		 244 aa  42.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>