13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2500 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2500  TonB-like  100 
 
 		 234 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4815  hypothetical protein  79 
 
 		 248 aa  228  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55330  hypothetical protein  77.63 
 
 		 248 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046002 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2197  hypothetical protein  43.57 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1089  TonB-like protein  36.64 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0297326  normal  0.161692 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2107  TonB-like protein  35.89 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.799306  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2568  TonB-dependent receptor, putative  29.19 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2401  TonB-dependent receptor, putative  25 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2990  hypothetical protein  27.59 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181047  normal  0.0324897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2917  hypothetical protein  33.84 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0359  TonB-dependent receptor, putative  28.57 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0337696 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2236  TonB-dependent receptor, putative  36.78 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313824  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2607  hypothetical protein  26.99 
 
 		 244 aa  42.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>