18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2568 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2568  TonB-dependent receptor, putative  100 
 
 
197 aa  379  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0359  TonB-dependent receptor, putative  53 
 
 
222 aa  153  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0337696 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2236  TonB-dependent receptor, putative  44.8 
 
 
220 aa  77.8  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1461  TonB-dependent receptor, putative  34.72 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2401  TonB-dependent receptor, putative  31.43 
 
 
235 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632898  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2223  hypothetical protein  41.67 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.692073  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2990  hypothetical protein  38.97 
 
 
238 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181047  normal  0.0324897 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2607  hypothetical protein  31.13 
 
 
244 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2917  hypothetical protein  38.55 
 
 
247 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4593  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2500  TonB-like  27.38 
 
 
234 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55560  hypothetical protein  33.77 
 
 
238 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0430636 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4815  hypothetical protein  28.75 
 
 
248 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4836  hypothetical protein  33.77 
 
 
227 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1636  TonB-like  30.56 
 
 
235 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.484992  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55330  hypothetical protein  26.25 
 
 
248 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2907  secretin/TonB-like protein  32.14 
 
 
226 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2215  hypothetical protein  32.1 
 
 
229 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.231176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1075  hypothetical protein  35.53 
 
 
248 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.80044  normal  0.490012 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>