92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4836 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4836  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  441  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55560  hypothetical protein  83.26 
 
 		 238 aa  362  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0430636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3199  secretin/TonB, short-like  53.43 
 
 		 239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762853  hitchhiker  0.00345438 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3129  secretin/TonB, short-like protein  37.37 
 
 		 251 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.828632  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2204  hypothetical protein  38.97 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268993  normal  0.0685137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0479  secretin/TonB, short-like protein  37.24 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.084644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1075  hypothetical protein  36.92 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.80044  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2907  secretin/TonB-like protein  35.42 
 
 		 226 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2211  hypothetical protein  34.74 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2231  secretin/TonB, short-like protein  36.65 
 
 		 206 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2220  Secretin/TonB short domain  32.64 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2100  hypothetical protein  30.15 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.223696  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2215  hypothetical protein  28.12 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.231176 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0725  TonB-dependent receptor protein  35.48 
 
 		 633 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3314  TonB-dependent receptor  35.65 
 
 		 973 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  40.23 
 
 		 815 aa  55.5  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  47.37 
 
 		 817 aa  55.1  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  40 
 
 		 778 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  44.93 
 
 		 833 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  38.89 
 
 		 802 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  41.67 
 
 		 778 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  40.7 
 
 		 833 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 864 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  32.93 
 
 		 787 aa  52.8  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  32.2 
 
 		 815 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  36.75 
 
 		 862 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0359  TonB-dependent receptor, putative  35.06 
 
 		 222 aa  52  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0337696 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  30.23 
 
 		 774 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  30.23 
 
 		 774 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  30.23 
 
 		 774 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  30.23 
 
 		 774 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  35.06 
 
 		 774 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  40.28 
 
 		 804 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2389  TonB-dependent receptor  37.63 
 
 		 823 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.687523  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  35.96 
 
 		 812 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  35.9 
 
 		 862 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  38.16 
 
 		 804 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  36.25 
 
 		 812 aa  49.7  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  31.91 
 
 		 816 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  33.03 
 
 		 801 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  40 
 
 		 863 aa  49.3  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  33.03 
 
 		 801 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  48.33 
 
 		 847 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  35.71 
 
 		 799 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2568  TonB-dependent receptor, putative  33.77 
 
 		 197 aa  48.5  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  32.98 
 
 		 813 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  32.8 
 
 		 863 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4301  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 1018 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.15211 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2401  TonB-dependent receptor, putative  24.42 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  32.61 
 
 		 829 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  34.57 
 
 		 816 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  27.78 
 
 		 861 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  40.74 
 
 		 812 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  41.94 
 
 		 1188 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  39.74 
 
 		 867 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  34.29 
 
 		 836 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  40 
 
 		 821 aa  45.4  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  34.92 
 
 		 796 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 800 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  34.19 
 
 		 862 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0997  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 		 935 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 782 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  39.78 
 
 		 819 aa  44.3  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  40.48 
 
 		 881 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  40.48 
 
 		 881 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  40.48 
 
 		 881 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  40.48 
 
 		 921 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  40.48 
 
 		 921 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64710  putative extracellular heme-binding protein  28.31 
 
 		 989 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.572363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 817 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  38.75 
 
 		 812 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  27.91 
 
 		 795 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 835 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 		 897 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 828 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  36.14 
 
 		 814 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 808 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1967  TonB-dependent receptor plug  38.57 
 
 		 929 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.559589 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  43.24 
 
 		 882 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  36.59 
 
 		 802 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  34.72 
 
 		 801 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  37.63 
 
 		 796 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2977  TonB-dependent receptor, plug  38.71 
 
 		 518 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826241  normal  0.256941 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  34.25 
 
 		 777 aa  42.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  34.67 
 
 		 782 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  37.84 
 
 		 804 aa  43.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  36.36 
 
 		 856 aa  42.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  33.73 
 
 		 794 aa  42.4  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2679  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 1054 aa  42  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  35.63 
 
 		 799 aa  41.6  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  31.94 
 
 		 809 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  38.71 
 
 		 1186 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>