126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3199 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3199  secretin/TonB, short-like  100 
 
 		 239 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762853  hitchhiker  0.00345438 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55560  hypothetical protein  51.97 
 
 		 238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0430636 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4836  hypothetical protein  50.88 
 
 		 227 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2907  secretin/TonB-like protein  34.65 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1075  hypothetical protein  38.46 
 
 		 248 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.80044  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3129  secretin/TonB, short-like protein  35.94 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.828632  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0479  secretin/TonB, short-like protein  34.2 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.084644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2204  hypothetical protein  31.55 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268993  normal  0.0685137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2211  hypothetical protein  33.16 
 
 		 237 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2231  secretin/TonB, short-like protein  32.22 
 
 		 206 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2215  hypothetical protein  31.44 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.231176 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2100  hypothetical protein  29.35 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.223696  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2220  Secretin/TonB short domain  31.18 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27532  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  33.52 
 
 		 812 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 1188 aa  62.8  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  38.24 
 
 		 816 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0997  TonB-dependent receptor plug  34.69 
 
 		 935 aa  59.3  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  32.73 
 
 		 782 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  36.71 
 
 		 782 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1720  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  32.34 
 
 		 885 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95463  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  37.93 
 
 		 815 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20010  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  31.74 
 
 		 891 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0486368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  39.08 
 
 		 817 aa  57  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  39.13 
 
 		 836 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  35.87 
 
 		 777 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  35.42 
 
 		 801 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  37.38 
 
 		 833 aa  55.5  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0725  TonB-dependent receptor protein  36 
 
 		 633 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  44.74 
 
 		 822 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  31.62 
 
 		 798 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  30.43 
 
 		 774 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  46.67 
 
 		 847 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  32.11 
 
 		 812 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  38.03 
 
 		 774 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  41.67 
 
 		 833 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  37.04 
 
 		 797 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  40.32 
 
 		 864 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  33.94 
 
 		 828 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  29.03 
 
 		 799 aa  52.4  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3314  TonB-dependent receptor  37.38 
 
 		 973 aa  52.4  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  30.84 
 
 		 799 aa  52  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  42.25 
 
 		 811 aa  52  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  38.27 
 
 		 821 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  40.58 
 
 		 822 aa  51.6  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  36.94 
 
 		 784 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  36.7 
 
 		 883 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  41.43 
 
 		 799 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2186  TonB-dependent receptor  41.18 
 
 		 1040 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.996858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2401  TonB-dependent receptor, putative  29.55 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 828 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  41.67 
 
 		 821 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  31.71 
 
 		 774 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  31.71 
 
 		 774 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  29.3 
 
 		 809 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  34.31 
 
 		 784 aa  50.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  47.37 
 
 		 778 aa  50.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  34.78 
 
 		 795 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  31.71 
 
 		 774 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  31.71 
 
 		 774 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  31.71 
 
 		 774 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2389  TonB-dependent receptor  34.95 
 
 		 823 aa  49.7  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.687523  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4301  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 1018 aa  49.7  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.15211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 828 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 835 aa  49.3  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  29.17 
 
 		 789 aa  49.3  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  32.73 
 
 		 824 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  41.43 
 
 		 812 aa  48.9  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1967  TonB-dependent receptor plug  47.62 
 
 		 929 aa  48.9  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.559589 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  36.62 
 
 		 822 aa  48.5  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0658  secretin/TonB  42.37 
 
 		 507 aa  48.5  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  40.58 
 
 		 1186 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  30.63 
 
 		 815 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  33.33 
 
 		 804 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  31.09 
 
 		 828 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  35.29 
 
 		 796 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  36.05 
 
 		 802 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 831 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0785  TonB-dependent receptor, plug  29.81 
 
 		 829 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324932  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  40.32 
 
 		 804 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2977  TonB-dependent receptor, plug  37.5 
 
 		 518 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826241  normal  0.256941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  36.36 
 
 		 804 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  32.65 
 
 		 814 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  30.67 
 
 		 828 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  38.6 
 
 		 807 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  32.8 
 
 		 803 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  45.45 
 
 		 796 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3722  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 896 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.275954  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  45.45 
 
 		 796 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 		 811 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  45.76 
 
 		 829 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  39.13 
 
 		 802 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  29.36 
 
 		 810 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  32.18 
 
 		 829 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  30.69 
 
 		 812 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  32.56 
 
 		 809 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4653  TonB-dependent receptor plug  36.62 
 
 		 836 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  30.56 
 
 		 792 aa  45.4  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  33.75 
 
 		 863 aa  45.4  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  34.31 
 
 		 810 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  32.5 
 
 		 802 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>