25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2401 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2401  TonB-dependent receptor, putative  100 
 
 
235 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632898  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0359  TonB-dependent receptor, putative  32.26 
 
 
222 aa  85.1  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0337696 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2568  TonB-dependent receptor, putative  28.03 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2990  hypothetical protein  32.18 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181047  normal  0.0324897 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2607  hypothetical protein  26.99 
 
 
244 aa  63.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2236  TonB-dependent receptor, putative  32.97 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1461  TonB-dependent receptor, putative  25.99 
 
 
242 aa  59.7  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2907  secretin/TonB-like protein  27.93 
 
 
226 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2197  hypothetical protein  29.03 
 
 
233 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4815  hypothetical protein  25.69 
 
 
248 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2100  hypothetical protein  28.28 
 
 
276 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.223696  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3129  secretin/TonB, short-like protein  28.89 
 
 
251 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.828632  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55330  hypothetical protein  25.69 
 
 
248 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046002 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3199  secretin/TonB, short-like  29.55 
 
 
239 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762853  hitchhiker  0.00345438 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1075  hypothetical protein  30 
 
 
248 aa  48.9  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.80044  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55560  hypothetical protein  25 
 
 
238 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0430636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2223  hypothetical protein  29.08 
 
 
247 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.692073  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4836  hypothetical protein  25 
 
 
227 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2500  TonB-like  23.53 
 
 
234 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2211  hypothetical protein  29.27 
 
 
237 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1098  hypothetical protein  42.11 
 
 
160 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.732446  normal  0.0769565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0479  secretin/TonB, short-like protein  27.96 
 
 
260 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.084644  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2107  TonB-like protein  28 
 
 
224 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.799306  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2231  secretin/TonB, short-like protein  20.31 
 
 
206 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2220  Secretin/TonB short domain  30 
 
 
226 aa  41.6  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27532  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>