19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2223 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2223  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.692073  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2917  hypothetical protein  76.58 
 
 		 247 aa  248  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2990  hypothetical protein  55.6 
 
 		 238 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181047  normal  0.0324897 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2568  TonB-dependent receptor, putative  42.86 
 
 		 197 aa  99  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0359  TonB-dependent receptor, putative  37.14 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0337696 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2401  TonB-dependent receptor, putative  28.12 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1461  TonB-dependent receptor, putative  31.98 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2215  hypothetical protein  36.26 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.231176 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4815  hypothetical protein  28.74 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0026  TonB-dependent receptor, putative  27.94 
 
 		 226 aa  49.3  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.429014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2500  TonB-like  27.59 
 
 		 234 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3129  secretin/TonB, short-like protein  34.78 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.828632  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55330  hypothetical protein  26.44 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046002 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1089  TonB-like protein  27.74 
 
 		 232 aa  45.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0297326  normal  0.161692 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2907  secretin/TonB-like protein  29.17 
 
 		 226 aa  45.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2107  TonB-like protein  27.16 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.799306  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2100  hypothetical protein  28.26 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.223696  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2197  hypothetical protein  22.99 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0204  TonB family protein  30.59 
 
 		 245 aa  42  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000615239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>