92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2100 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2100  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  531  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.223696  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3129  secretin/TonB, short-like protein  34.56 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.828632  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2907  secretin/TonB-like protein  33.48 
 
 		 226 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2211  hypothetical protein  30.49 
 
 		 237 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0479  secretin/TonB, short-like protein  30.64 
 
 		 260 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.084644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3199  secretin/TonB, short-like  29.77 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762853  hitchhiker  0.00345438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4836  hypothetical protein  30.15 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55560  hypothetical protein  32.16 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0430636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2215  hypothetical protein  28.71 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.231176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1075  hypothetical protein  28.64 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.80044  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2204  hypothetical protein  28.37 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268993  normal  0.0685137 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 835 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  41.35 
 
 		 819 aa  62.8  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2220  Secretin/TonB short domain  31.11 
 
 		 226 aa  62  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2231  secretin/TonB, short-like protein  30.57 
 
 		 206 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  44.87 
 
 		 829 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0725  TonB-dependent receptor protein  37.3 
 
 		 633 aa  59.3  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  40 
 
 		 862 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  40 
 
 		 862 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  50.88 
 
 		 778 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  36.64 
 
 		 863 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  40.22 
 
 		 862 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  41.38 
 
 		 794 aa  56.2  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  29.41 
 
 		 864 aa  55.5  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  43.18 
 
 		 867 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  45.07 
 
 		 778 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  36.67 
 
 		 821 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  34.45 
 
 		 815 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  31.21 
 
 		 836 aa  52.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0658  secretin/TonB  41.98 
 
 		 507 aa  52.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  35.48 
 
 		 861 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3314  TonB-dependent receptor  40.58 
 
 		 973 aa  52.4  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  36.49 
 
 		 782 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  31.78 
 
 		 822 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  32.79 
 
 		 1186 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  35.82 
 
 		 1188 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  31.4 
 
 		 828 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  39.71 
 
 		 812 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  40.68 
 
 		 864 aa  49.7  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  31.4 
 
 		 817 aa  49.7  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  29.91 
 
 		 817 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  34.51 
 
 		 897 aa  49.3  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  36.92 
 
 		 821 aa  48.9  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2401  TonB-dependent receptor, putative  28.87 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632898  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  35.62 
 
 		 782 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2531  TonB-dependent receptor  37.93 
 
 		 843 aa  47.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  31.94 
 
 		 828 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  33.87 
 
 		 802 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  32.38 
 
 		 841 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 833 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0359  TonB-dependent receptor, putative  30.4 
 
 		 222 aa  48.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0337696 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  37.33 
 
 		 813 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  29.91 
 
 		 808 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  36.99 
 
 		 816 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0896  TonB-dependent receptor  36.23 
 
 		 149 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.221144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  35.59 
 
 		 804 aa  46.6  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  36.99 
 
 		 807 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  35.14 
 
 		 812 aa  46.2  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  36.51 
 
 		 815 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 		 808 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1814  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  34 
 
 		 892 aa  45.8  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2977  TonB-dependent receptor, plug  30.39 
 
 		 518 aa  45.8  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826241  normal  0.256941 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2296  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 752 aa  46.2  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3280  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 923 aa  45.8  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4401  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 756 aa  45.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78723  normal  0.0995472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  34.65 
 
 		 819 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  36.67 
 
 		 802 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  35.9 
 
 		 921 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  35.9 
 
 		 921 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  35.9 
 
 		 881 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  35.9 
 
 		 881 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  34.41 
 
 		 822 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  29.6 
 
 		 792 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  31.94 
 
 		 787 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  35.9 
 
 		 881 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  41.38 
 
 		 808 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  38.24 
 
 		 847 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  33.98 
 
 		 844 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1411  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  37.18 
 
 		 892 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  35.9 
 
 		 827 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 826 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  34.07 
 
 		 804 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2243  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 1000 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 777 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  34.15 
 
 		 799 aa  43.5  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  37.14 
 
 		 799 aa  43.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  31.25 
 
 		 809 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  34.78 
 
 		 809 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20010  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  32.39 
 
 		 891 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0486368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 814 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  34.62 
 
 		 882 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  30.11 
 
 		 809 aa  42  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>