116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0479 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0479  secretin/TonB, short-like protein  100 
 
 		 260 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.084644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3129  secretin/TonB, short-like protein  41.15 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.828632  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55560  hypothetical protein  39.8 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0430636 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4836  hypothetical protein  37.24 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3199  secretin/TonB, short-like  36.79 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762853  hitchhiker  0.00345438 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2211  hypothetical protein  36.81 
 
 		 237 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2907  secretin/TonB-like protein  33.64 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2220  Secretin/TonB short domain  32.86 
 
 		 226 aa  89.7  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2204  hypothetical protein  32.82 
 
 		 217 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268993  normal  0.0685137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2231  secretin/TonB, short-like protein  36.49 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2100  hypothetical protein  29.61 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.223696  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2215  hypothetical protein  31.84 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.231176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1075  hypothetical protein  31.38 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.80044  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  35.29 
 
 		 804 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  37.17 
 
 		 804 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  41.49 
 
 		 844 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  48.61 
 
 		 778 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  50 
 
 		 822 aa  59.7  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3314  TonB-dependent receptor  52.17 
 
 		 973 aa  58.9  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  45.59 
 
 		 817 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  47.95 
 
 		 812 aa  57.4  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  47.83 
 
 		 802 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  45.83 
 
 		 821 aa  57  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  38.75 
 
 		 804 aa  56.2  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 782 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  35.11 
 
 		 807 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0658  secretin/TonB  49.15 
 
 		 507 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  45.57 
 
 		 833 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  53.45 
 
 		 778 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  36.45 
 
 		 792 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 835 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2977  TonB-dependent receptor, plug  43.21 
 
 		 518 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826241  normal  0.256941 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2186  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 1040 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.996858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  41.33 
 
 		 862 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  36.45 
 
 		 798 aa  53.1  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  41.33 
 
 		 862 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  42.25 
 
 		 829 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  33.61 
 
 		 814 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0725  TonB-dependent receptor protein  42.68 
 
 		 633 aa  52  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  37.5 
 
 		 822 aa  51.6  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  42.86 
 
 		 1188 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  50 
 
 		 808 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  46.67 
 
 		 829 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  54.39 
 
 		 1186 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  35.78 
 
 		 861 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  44.07 
 
 		 812 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  40 
 
 		 813 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  41.89 
 
 		 862 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  40.79 
 
 		 801 aa  49.3  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  42.25 
 
 		 809 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2389  TonB-dependent receptor  47.46 
 
 		 823 aa  49.3  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.687523  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  36.36 
 
 		 816 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  37.18 
 
 		 795 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  35.45 
 
 		 800 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  44.83 
 
 		 864 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  44.12 
 
 		 809 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 897 aa  48.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  42.65 
 
 		 809 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  32.93 
 
 		 815 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  44.07 
 
 		 821 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  39.08 
 
 		 802 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  41.79 
 
 		 811 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  41.25 
 
 		 807 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  41.33 
 
 		 794 aa  47  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  34.58 
 
 		 817 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  41.1 
 
 		 833 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2401  TonB-dependent receptor, putative  27.96 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  34.58 
 
 		 808 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  39.73 
 
 		 806 aa  46.6  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  35.53 
 
 		 812 aa  46.2  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  44.78 
 
 		 839 aa  46.2  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  47.14 
 
 		 863 aa  46.2  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  41.18 
 
 		 809 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  34.21 
 
 		 815 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  39.19 
 
 		 819 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  38.57 
 
 		 793 aa  45.8  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2679  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 1054 aa  45.8  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  37.78 
 
 		 797 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  34.95 
 
 		 799 aa  45.4  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  34.15 
 
 		 902 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  37.5 
 
 		 801 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  31.63 
 
 		 782 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  34.13 
 
 		 857 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  39.34 
 
 		 787 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  41.43 
 
 		 809 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3124  TonB-dependent receptor  34.67 
 
 		 973 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  37.5 
 
 		 801 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 1074 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  37.78 
 
 		 806 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  38.24 
 
 		 851 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  46.38 
 
 		 822 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  36.67 
 
 		 799 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  43.86 
 
 		 847 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  40.28 
 
 		 784 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  37.66 
 
 		 826 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  32.76 
 
 		 836 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3810  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 		 934 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0593009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  36.17 
 
 		 859 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2303  TonB-dependent receptor  39.13 
 
 		 982 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243733  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  33.33 
 
 		 774 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>