121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2215 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2215  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.231176 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2907  secretin/TonB-like protein  38.6 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3129  secretin/TonB, short-like protein  30.3 
 
 		 251 aa  88.6  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.828632  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3199  secretin/TonB, short-like  31.44 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762853  hitchhiker  0.00345438 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2100  hypothetical protein  29.85 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.223696  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0479  secretin/TonB, short-like protein  32.34 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.084644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55560  hypothetical protein  28.57 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0430636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2211  hypothetical protein  30.96 
 
 		 237 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4836  hypothetical protein  28.12 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2204  hypothetical protein  28.65 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268993  normal  0.0685137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2231  secretin/TonB, short-like protein  29.08 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  38.74 
 
 		 807 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  41.28 
 
 		 1186 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  32.69 
 
 		 808 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  44.44 
 
 		 821 aa  59.7  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  42.86 
 
 		 812 aa  59.7  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  36.3 
 
 		 822 aa  57.4  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1988  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 1020 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1075  hypothetical protein  25.37 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.80044  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  40.23 
 
 		 862 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  40.57 
 
 		 778 aa  56.2  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  45.07 
 
 		 862 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3314  TonB-dependent receptor  32.82 
 
 		 973 aa  56.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  30.77 
 
 		 817 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 833 aa  55.8  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  40.85 
 
 		 813 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  29.81 
 
 		 808 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0896  TonB-dependent receptor  33.96 
 
 		 149 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.221144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  35.96 
 
 		 861 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  33.71 
 
 		 1188 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  37.5 
 
 		 792 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  39.19 
 
 		 809 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  36.11 
 
 		 862 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  38.82 
 
 		 829 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4401  TonB-dependent receptor  33.7 
 
 		 756 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78723  normal  0.0995472 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  36.99 
 
 		 801 aa  52.8  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  36.75 
 
 		 809 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  34.48 
 
 		 809 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  36.59 
 
 		 794 aa  52  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  37.1 
 
 		 809 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  44.07 
 
 		 864 aa  52  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  36.52 
 
 		 796 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2389  TonB-dependent receptor  41.89 
 
 		 823 aa  52  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.687523  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2990  hypothetical protein  41.77 
 
 		 238 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181047  normal  0.0324897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  37.68 
 
 		 816 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  33.62 
 
 		 807 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2383  TonB-dependent receptor  39.73 
 
 		 926 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1411  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  35.37 
 
 		 892 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  32.63 
 
 		 864 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  40.85 
 
 		 821 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20010  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  36.49 
 
 		 891 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0486368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  33.01 
 
 		 835 aa  49.7  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  29.01 
 
 		 836 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  36.79 
 
 		 796 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  35.71 
 
 		 844 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4013  TonB-dependent siderophore receptor  33.63 
 
 		 879 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302904 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  39.13 
 
 		 819 aa  48.5  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  33.71 
 
 		 863 aa  48.5  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1814  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  32.04 
 
 		 892 aa  48.5  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  42.37 
 
 		 826 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  39.47 
 
 		 799 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2243  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 1000 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  34.38 
 
 		 809 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2071  hypothetical protein  37.04 
 
 		 176 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  40.32 
 
 		 799 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0658  secretin/TonB  30.99 
 
 		 507 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2568  TonB-dependent receptor, putative  32.1 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1720  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  35.14 
 
 		 885 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95463  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  40.68 
 
 		 851 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5620  putative extracellular heme-binding protein  38.98 
 
 		 930 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253718  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  35.42 
 
 		 796 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4077  cyclic nucleotide-binding protein  35.29 
 
 		 959 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3757  TonB-dependent siderophore receptor  33.62 
 
 		 851 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0566087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  32.61 
 
 		 857 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  33.01 
 
 		 815 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  34.74 
 
 		 778 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  31.43 
 
 		 829 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2622  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 743 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00560047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  28.07 
 
 		 782 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  33.02 
 
 		 806 aa  45.4  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  28.12 
 
 		 782 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2917  hypothetical protein  45.31 
 
 		 247 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  36.36 
 
 		 796 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0997  TonB-dependent receptor plug  33.73 
 
 		 935 aa  45.1  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  30 
 
 		 789 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0725  TonB-dependent receptor protein  31.78 
 
 		 633 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2223  hypothetical protein  38.89 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.692073  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  34.44 
 
 		 839 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  37.29 
 
 		 851 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  32.58 
 
 		 804 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  33.05 
 
 		 812 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  28.71 
 
 		 859 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  38.24 
 
 		 784 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  31.11 
 
 		 809 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  35.62 
 
 		 867 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3810  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 934 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0593009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  33.71 
 
 		 806 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  36.71 
 
 		 839 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  27.19 
 
 		 802 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5189  TonB-dependent receptor  40.68 
 
 		 981 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>