111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2211 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2211  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3129  secretin/TonB, short-like protein  33.51 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.828632  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55560  hypothetical protein  34.57 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0430636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3199  secretin/TonB, short-like  33.16 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762853  hitchhiker  0.00345438 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0479  secretin/TonB, short-like protein  36.81 
 
 		 260 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.084644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2907  secretin/TonB-like protein  33.5 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4836  hypothetical protein  32.74 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2100  hypothetical protein  30.85 
 
 		 276 aa  90.9  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.223696  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2204  hypothetical protein  32.29 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268993  normal  0.0685137 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2220  Secretin/TonB short domain  36.41 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2215  hypothetical protein  30.32 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.231176 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2231  secretin/TonB, short-like protein  32.12 
 
 		 206 aa  72  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3314  TonB-dependent receptor  45.22 
 
 		 973 aa  67  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  41 
 
 		 862 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  42.55 
 
 		 862 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1075  hypothetical protein  29.54 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.80044  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  47.19 
 
 		 812 aa  65.1  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  38.89 
 
 		 787 aa  62.8  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  41.05 
 
 		 833 aa  62  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 835 aa  62  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  42.55 
 
 		 821 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  47.83 
 
 		 836 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  38 
 
 		 862 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  45.71 
 
 		 861 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  47.89 
 
 		 863 aa  58.9  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  38.89 
 
 		 812 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0658  secretin/TonB  33.93 
 
 		 507 aa  57  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  45.21 
 
 		 822 aa  57.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  40.86 
 
 		 778 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  40.32 
 
 		 807 aa  55.8  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  37.93 
 
 		 1188 aa  55.8  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  43.86 
 
 		 864 aa  55.8  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  42.03 
 
 		 844 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2389  TonB-dependent receptor  44.59 
 
 		 823 aa  55.5  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.687523  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  40.98 
 
 		 815 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  37.4 
 
 		 1186 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  41.18 
 
 		 778 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  46.03 
 
 		 829 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2303  TonB-dependent receptor  39.45 
 
 		 982 aa  53.1  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243733  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  42.03 
 
 		 812 aa  52.8  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  44.44 
 
 		 808 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  43.68 
 
 		 792 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  41.76 
 
 		 810 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  42.11 
 
 		 807 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  36.28 
 
 		 867 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2977  TonB-dependent receptor, plug  43.08 
 
 		 518 aa  50.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826241  normal  0.256941 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  36.96 
 
 		 806 aa  49.7  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  40.86 
 
 		 804 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  37.08 
 
 		 815 aa  49.3  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  31.9 
 
 		 864 aa  49.3  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  42.11 
 
 		 817 aa  49.3  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2186  TonB-dependent receptor  38.61 
 
 		 1040 aa  49.3  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.996858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0725  TonB-dependent receptor protein  29.63 
 
 		 633 aa  48.5  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  45.16 
 
 		 802 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64710  putative extracellular heme-binding protein  36.19 
 
 		 989 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.572363  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  36.7 
 
 		 857 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  34.74 
 
 		 794 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4401  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 756 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78723  normal  0.0995472 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2401  TonB-dependent receptor, putative  29.27 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  35.04 
 
 		 809 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  35.9 
 
 		 799 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  37.65 
 
 		 829 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  36.46 
 
 		 856 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  37.65 
 
 		 804 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  34.88 
 
 		 801 aa  46.2  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.47 
 
 		 833 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  28.7 
 
 		 809 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  45.45 
 
 		 826 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  32.1 
 
 		 795 aa  46.6  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  31.68 
 
 		 811 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  41.67 
 
 		 847 aa  46.2  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  32.14 
 
 		 859 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  35.63 
 
 		 804 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  34.21 
 
 		 774 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  34.21 
 
 		 774 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  34.21 
 
 		 774 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  34.21 
 
 		 774 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  34.21 
 
 		 774 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  41.67 
 
 		 812 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  48.28 
 
 		 858 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  32.67 
 
 		 811 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0896  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 149 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.221144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  32.73 
 
 		 789 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 828 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2383  TonB-dependent receptor  36.47 
 
 		 926 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  42.65 
 
 		 809 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1881  hypothetical protein  28.3 
 
 		 176 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2679  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 1054 aa  43.5  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  33.98 
 
 		 798 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  39.24 
 
 		 809 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1411  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.47 
 
 		 892 aa  43.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1492  TonB-dependent receptor  37.25 
 
 		 977 aa  43.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.442431 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  23.78 
 
 		 802 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 793 aa  42.7  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  38.1 
 
 		 816 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  40.96 
 
 		 831 aa  42.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  36.05 
 
 		 863 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  32.58 
 
 		 825 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  46.55 
 
 		 855 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  46.55 
 
 		 855 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>