23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1881 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1881  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  363  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2071  hypothetical protein  84.09 
 
 		 176 aa  317  6e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2231  secretin/TonB, short-like protein  37.5 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  34.07 
 
 		 1188 aa  53.9  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  32.22 
 
 		 844 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  32.56 
 
 		 816 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  33.71 
 
 		 810 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  27.69 
 
 		 812 aa  45.1  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  35.82 
 
 		 802 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0855  putative lipoprotein  29.29 
 
 		 107 aa  44.3  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2211  hypothetical protein  29.09 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 835 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2215  hypothetical protein  35.82 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.231176 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  29.87 
 
 		 782 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  32.58 
 
 		 810 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  26 
 
 		 782 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  29.81 
 
 		 812 aa  42  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  29.76 
 
 		 824 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0641  putative lipoprotein  29.73 
 
 		 107 aa  41.6  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  31.46 
 
 		 810 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  30.11 
 
 		 811 aa  41.6  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1224  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 908 aa  41.6  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.735079  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  28.05 
 
 		 787 aa  41.2  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>