15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2071 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2071  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  363  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1881  hypothetical protein  84.09 
 
 		 176 aa  317  6e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  34.07 
 
 		 1188 aa  54.7  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2231  secretin/TonB, short-like protein  34.95 
 
 		 206 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2215  hypothetical protein  37.04 
 
 		 229 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.231176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  31.46 
 
 		 816 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  35.82 
 
 		 802 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  32.58 
 
 		 844 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  30.34 
 
 		 810 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  25.77 
 
 		 782 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0855  putative lipoprotein  32.79 
 
 		 107 aa  42.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  26.8 
 
 		 782 aa  41.6  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2211  hypothetical protein  31.51 
 
 		 237 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 		 811 aa  41.2  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1224  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 908 aa  41.2  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.735079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>