82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2220 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2220  Secretin/TonB short domain  100 
 
 		 226 aa  448  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3129  secretin/TonB, short-like protein  34.55 
 
 		 251 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.828632  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0479  secretin/TonB, short-like protein  32.86 
 
 		 260 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.084644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55560  hypothetical protein  33.68 
 
 		 238 aa  92  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0430636 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1075  hypothetical protein  32.44 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.80044  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4836  hypothetical protein  33.68 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2211  hypothetical protein  36.41 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2204  hypothetical protein  29.74 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268993  normal  0.0685137 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3199  secretin/TonB, short-like  31.18 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762853  hitchhiker  0.00345438 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2231  secretin/TonB, short-like protein  27.07 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3314  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 973 aa  66.6  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  40 
 
 		 862 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  42.86 
 
 		 862 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2100  hypothetical protein  29.27 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.223696  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 835 aa  62.8  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  39.76 
 
 		 862 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  38.27 
 
 		 861 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  41.03 
 
 		 821 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0658  secretin/TonB  40.62 
 
 		 507 aa  55.8  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  31.58 
 
 		 807 aa  55.8  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  41.79 
 
 		 829 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  34.04 
 
 		 812 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2389  TonB-dependent receptor  38.55 
 
 		 823 aa  52  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.687523  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2907  secretin/TonB-like protein  27.27 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  41.03 
 
 		 867 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  34.67 
 
 		 857 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3810  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 934 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0593009  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  34.57 
 
 		 809 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  33.73 
 
 		 822 aa  50.1  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  32.67 
 
 		 826 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  32.69 
 
 		 809 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  36.59 
 
 		 836 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  37.14 
 
 		 804 aa  48.5  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  32.84 
 
 		 1188 aa  47.8  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  34.83 
 
 		 792 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  35.29 
 
 		 813 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 809 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  40.28 
 
 		 881 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  39.06 
 
 		 799 aa  46.6  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  40.28 
 
 		 881 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  40.28 
 
 		 881 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  36.23 
 
 		 778 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  40.28 
 
 		 921 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  40.28 
 
 		 921 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  34.57 
 
 		 809 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  34.15 
 
 		 856 aa  46.2  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  36.67 
 
 		 807 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  33.82 
 
 		 816 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  41.67 
 
 		 821 aa  45.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  37.14 
 
 		 817 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  37.14 
 
 		 808 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2186  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 1040 aa  45.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.996858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  36.84 
 
 		 844 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  30.39 
 
 		 859 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2401  TonB-dependent receptor, putative  30 
 
 		 235 aa  45.1  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  36.05 
 
 		 802 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  36.11 
 
 		 778 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  35.29 
 
 		 839 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5189  TonB-dependent receptor  32.91 
 
 		 981 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2977  TonB-dependent receptor, plug  36.11 
 
 		 518 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826241  normal  0.256941 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  35.44 
 
 		 858 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 863 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  35.71 
 
 		 808 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  33.73 
 
 		 782 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  42.37 
 
 		 882 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  35.05 
 
 		 799 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  34.29 
 
 		 833 aa  43.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  35.71 
 
 		 812 aa  43.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  32.84 
 
 		 811 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  27.16 
 
 		 795 aa  42.4  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  33.73 
 
 		 782 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  36.25 
 
 		 794 aa  42.4  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  28.7 
 
 		 801 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  32.95 
 
 		 863 aa  42.4  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  36.99 
 
 		 793 aa  42  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 847 aa  42  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  35.71 
 
 		 804 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  32.47 
 
 		 799 aa  42  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  34.62 
 
 		 802 aa  42  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 803 aa  42  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  38.46 
 
 		 795 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1492  TonB-dependent receptor  35.92 
 
 		 977 aa  41.6  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.442431 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>