74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2204 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2204  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268993  normal  0.0685137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4836  hypothetical protein  41.54 
 
 		 227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55560  hypothetical protein  41.36 
 
 		 238 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0430636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3199  secretin/TonB, short-like  33.65 
 
 		 239 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762853  hitchhiker  0.00345438 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3129  secretin/TonB, short-like protein  30.37 
 
 		 251 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.828632  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0479  secretin/TonB, short-like protein  34.36 
 
 		 260 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.084644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2907  secretin/TonB-like protein  32.21 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2211  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1075  hypothetical protein  31.98 
 
 		 248 aa  85.5  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.80044  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2220  Secretin/TonB short domain  32.16 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2100  hypothetical protein  28.43 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.223696  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2215  hypothetical protein  29.08 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.231176 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2231  secretin/TonB, short-like protein  27.78 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  53.45 
 
 		 882 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  38.38 
 
 		 833 aa  56.2  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  51.72 
 
 		 921 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  51.72 
 
 		 921 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  39.77 
 
 		 829 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  51.72 
 
 		 881 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  51.72 
 
 		 881 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  51.72 
 
 		 881 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0725  TonB-dependent receptor protein  36.04 
 
 		 633 aa  55.1  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4301  TonB-dependent receptor  41.43 
 
 		 1018 aa  52.4  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.15211 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  45.45 
 
 		 821 aa  49.3  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  35.23 
 
 		 782 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  31.46 
 
 		 813 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  28 
 
 		 774 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  32.29 
 
 		 803 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  30.39 
 
 		 782 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  31.82 
 
 		 816 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  35.44 
 
 		 825 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  44.07 
 
 		 807 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  37.8 
 
 		 863 aa  47.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  37.65 
 
 		 778 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  36.47 
 
 		 812 aa  47.8  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  35.56 
 
 		 804 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  33.77 
 
 		 774 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  31.86 
 
 		 777 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  33.66 
 
 		 804 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  28.68 
 
 		 863 aa  45.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  40.51 
 
 		 858 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  45.61 
 
 		 784 aa  45.8  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1461  TonB-dependent receptor, putative  36.67 
 
 		 242 aa  45.4  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2977  TonB-dependent receptor, plug  37.66 
 
 		 518 aa  45.1  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826241  normal  0.256941 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  33.64 
 
 		 806 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  38.03 
 
 		 864 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  40.68 
 
 		 821 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  31 
 
 		 801 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4013  TonB-dependent siderophore receptor  47.46 
 
 		 879 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302904 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 809 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  31.87 
 
 		 812 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  43.1 
 
 		 855 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  31.71 
 
 		 799 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  42.42 
 
 		 812 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  43.1 
 
 		 855 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  43.1 
 
 		 847 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  41.38 
 
 		 840 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 1074 aa  43.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  30.11 
 
 		 795 aa  43.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.44 
 
 		 833 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  30.89 
 
 		 802 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  41.54 
 
 		 822 aa  43.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1967  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 		 929 aa  42.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.559589 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  32.67 
 
 		 778 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  41.1 
 
 		 794 aa  42.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  34.44 
 
 		 820 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3314  TonB-dependent receptor  38.96 
 
 		 973 aa  42.4  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64710  putative extracellular heme-binding protein  40.35 
 
 		 989 aa  42  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.572363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 1188 aa  42.4  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  34.44 
 
 		 794 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  43.66 
 
 		 796 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  33.04 
 
 		 862 aa  42  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0896  TonB-dependent receptor  36.11 
 
 		 149 aa  41.6  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.221144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2679  TonB-dependent receptor  40.68 
 
 		 1054 aa  41.6  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>