151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0997 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3287  TonB-dependent receptor plug  41.12 
 
 		 856 aa  664    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550182  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0760  TonB-dependent receptor plug  41.44 
 
 		 867 aa  652    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0997  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 935 aa  1943    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2212  putative TonB dependent receptor  31.69 
 
 		 862 aa  385  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1224  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 908 aa  372  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.735079  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0932  putative TonB dependent receptor  29.44 
 
 		 859 aa  355  2e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.175288  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1947  hypothetical protein  29.24 
 
 		 859 aa  350  8e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.205768  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1678  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 790 aa  312  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1580  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 790 aa  312  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1685  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 790 aa  312  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2108  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 790 aa  311  5e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347716  normal  0.376393 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2151  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 790 aa  308  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2162  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 790 aa  308  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1759  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 790 aa  307  7e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.949304  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01453  predicted porin protein  28.29 
 
 		 790 aa  306  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01466  hypothetical protein  28.29 
 
 		 790 aa  306  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3810  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 934 aa  292  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0593009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0846  TonB-dependent receptor, plug  26.32 
 
 		 879 aa  243  9e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2599  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 840 aa  211  7e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0447  TonB dependent receptor domain-containing protein  25.77 
 
 		 841 aa  209  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000427237  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0894  hypothetical protein  27.69 
 
 		 488 aa  159  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0893  hypothetical protein  24.3 
 
 		 266 aa  76.3  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  26.74 
 
 		 809 aa  71.2  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  27.17 
 
 		 807 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  26.41 
 
 		 809 aa  69.7  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  27.27 
 
 		 799 aa  67.8  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 883 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  39.77 
 
 		 816 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  25.7 
 
 		 809 aa  65.5  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  28.24 
 
 		 817 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  29.63 
 
 		 808 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  33.03 
 
 		 822 aa  63.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  23.75 
 
 		 800 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  22.39 
 
 		 992 aa  62.8  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  40.57 
 
 		 799 aa  62.4  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1988  TonB-dependent receptor  36.19 
 
 		 1020 aa  61.6  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  43.3 
 
 		 789 aa  61.2  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  36.36 
 
 		 801 aa  60.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  33.12 
 
 		 851 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  23.14 
 
 		 814 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  38.1 
 
 		 1188 aa  59.7  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  33.12 
 
 		 851 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64710  putative extracellular heme-binding protein  35.79 
 
 		 989 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.572363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  41.46 
 
 		 809 aa  59.3  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  30.63 
 
 		 812 aa  59.3  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5620  putative extracellular heme-binding protein  35.11 
 
 		 930 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253718  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  37.76 
 
 		 812 aa  58.9  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  37.08 
 
 		 777 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  30.77 
 
 		 806 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  34.78 
 
 		 787 aa  58.5  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3199  secretin/TonB, short-like  34.69 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762853  hitchhiker  0.00345438 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  35 
 
 		 793 aa  58.5  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 864 aa  58.5  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 808 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  25.78 
 
 		 809 aa  58.2  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  46.88 
 
 		 804 aa  57.8  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 		 801 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2243  TonB-dependent receptor  39.76 
 
 		 1000 aa  57.4  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 		 801 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  23.61 
 
 		 801 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  25.73 
 
 		 815 aa  56.6  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  37.78 
 
 		 1186 aa  56.6  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1195  outer membrane receptor FepA  30.34 
 
 		 749 aa  55.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0821218  normal  0.246562 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2389  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 823 aa  55.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.687523  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  33.6 
 
 		 802 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  34.74 
 
 		 797 aa  55.1  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  34.74 
 
 		 774 aa  54.7  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  34.74 
 
 		 774 aa  54.7  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  33.71 
 
 		 774 aa  54.7  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  33.71 
 
 		 774 aa  54.7  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  33.71 
 
 		 774 aa  54.7  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  35.35 
 
 		 822 aa  54.7  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 800 aa  54.7  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  39.44 
 
 		 839 aa  53.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  40.28 
 
 		 813 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  25.76 
 
 		 778 aa  53.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.21 
 
 		 833 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  34.31 
 
 		 802 aa  53.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  24.29 
 
 		 825 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  34.26 
 
 		 774 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  40.28 
 
 		 816 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1152  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 790 aa  52.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  26.4 
 
 		 828 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  35.96 
 
 		 792 aa  52.4  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  36.9 
 
 		 774 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  33.73 
 
 		 782 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  35.71 
 
 		 784 aa  51.6  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  23.85 
 
 		 828 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 821 aa  50.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5189  TonB-dependent receptor  45.76 
 
 		 981 aa  50.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  23.35 
 
 		 841 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  22.6 
 
 		 994 aa  50.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  24.14 
 
 		 812 aa  49.7  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 864 aa  50.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  21.99 
 
 		 1012 aa  50.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 831 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  24.62 
 
 		 831 aa  50.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  29.36 
 
 		 782 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2977  TonB-dependent receptor, plug  35.23 
 
 		 518 aa  49.3  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826241  normal  0.256941 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4301  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 1018 aa  49.3  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.15211 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>