38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0760 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0997  TonB-dependent receptor plug  41.44 
 
 		 935 aa  662    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0760  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 867 aa  1793    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3287  TonB-dependent receptor plug  64.98 
 
 		 856 aa  1155    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550182  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2212  putative TonB dependent receptor  30.44 
 
 		 862 aa  356  1e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0932  putative TonB dependent receptor  30.22 
 
 		 859 aa  343  9e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.175288  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1224  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 908 aa  308  4.0000000000000004e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.735079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1947  hypothetical protein  29.14 
 
 		 859 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.205768  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1685  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 790 aa  286  9e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2108  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 790 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347716  normal  0.376393 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1580  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 790 aa  283  9e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1759  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 790 aa  283  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.949304  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1678  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 790 aa  282  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2151  TonB-dependent receptor plug  27.04 
 
 		 790 aa  281  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14868  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01466  hypothetical protein  27.16 
 
 		 790 aa  281  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01453  predicted porin protein  27.16 
 
 		 790 aa  281  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2162  TonB-dependent receptor plug  27.04 
 
 		 790 aa  281  4e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3810  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 934 aa  262  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0593009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0846  TonB-dependent receptor, plug  26.04 
 
 		 879 aa  242  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0447  TonB dependent receptor domain-containing protein  27.84 
 
 		 841 aa  228  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000427237  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2599  TonB-dependent receptor plug  26.26 
 
 		 840 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0894  hypothetical protein  25.85 
 
 		 488 aa  131  4.0000000000000003e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0893  hypothetical protein  25 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  22.37 
 
 		 992 aa  62.8  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  27.6 
 
 		 744 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1071 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  27.81 
 
 		 744 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  27.81 
 
 		 744 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  30.53 
 
 		 1012 aa  50.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  22.51 
 
 		 746 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1485  outer membrane receptor FepA  25.62 
 
 		 777 aa  47  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0839984  normal  0.152216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1074 aa  45.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  26.54 
 
 		 751 aa  45.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  38.81 
 
 		 849 aa  45.4  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  26.54 
 
 		 751 aa  45.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1195  outer membrane receptor FepA  28.48 
 
 		 749 aa  45.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0821218  normal  0.246562 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0435  heavy metal transport/detoxification protein  24.07 
 
 		 668 aa  44.7  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  26.54 
 
 		 751 aa  44.3  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  26.54 
 
 		 751 aa  44.3  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>