36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3287 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0997  TonB-dependent receptor plug  41.12 
 
 		 935 aa  683    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0760  TonB-dependent receptor plug  64.98 
 
 		 867 aa  1154    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3287  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 856 aa  1764    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550182  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2212  putative TonB dependent receptor  31.12 
 
 		 862 aa  356  1e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0932  putative TonB dependent receptor  30.79 
 
 		 859 aa  352  2e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.175288  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1224  TonB-dependent receptor  31.32 
 
 		 908 aa  330  7e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.735079  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1580  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 790 aa  321  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1678  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 790 aa  320  7e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1685  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 790 aa  320  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01453  predicted porin protein  29.25 
 
 		 790 aa  318  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01466  hypothetical protein  29.25 
 
 		 790 aa  318  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2108  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 790 aa  318  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347716  normal  0.376393 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2151  TonB-dependent receptor plug  29.18 
 
 		 790 aa  318  3e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2162  TonB-dependent receptor plug  29.12 
 
 		 790 aa  318  3e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1759  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 790 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.949304  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1947  hypothetical protein  28.59 
 
 		 859 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.205768  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0846  TonB-dependent receptor, plug  28.07 
 
 		 879 aa  275  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3810  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 934 aa  270  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0593009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0447  TonB dependent receptor domain-containing protein  27.14 
 
 		 841 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000427237  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2599  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 840 aa  200  7.999999999999999e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0894  hypothetical protein  24.01 
 
 		 488 aa  126  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  22.98 
 
 		 992 aa  83.6  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0893  hypothetical protein  20.77 
 
 		 266 aa  55.1  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  22.02 
 
 		 744 aa  54.7  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  27.36 
 
 		 759 aa  54.7  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3743  outer membrane receptor FepA  26.37 
 
 		 766 aa  53.5  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.325826  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  22.18 
 
 		 744 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  21.87 
 
 		 744 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  33.8 
 
 		 1012 aa  52.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1195  outer membrane receptor FepA  29.76 
 
 		 749 aa  52  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0821218  normal  0.246562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1074 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  22.05 
 
 		 746 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1071 aa  48.5  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1485  outer membrane receptor FepA  24.26 
 
 		 777 aa  47.8  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0839984  normal  0.152216 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  32.48 
 
 		 1010 aa  45.8  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 		 1007 aa  44.7  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>