17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0893 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0893  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  547  1e-155  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2212  putative TonB dependent receptor  23.66 
 
 		 862 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0760  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 867 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0932  putative TonB dependent receptor  25.1 
 
 		 859 aa  76.6  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.175288  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0997  TonB-dependent receptor plug  24.3 
 
 		 935 aa  76.3  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2162  TonB-dependent receptor plug  23.42 
 
 		 790 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1685  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 790 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01466  hypothetical protein  23.25 
 
 		 790 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01453  predicted porin protein  23.25 
 
 		 790 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1580  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 790 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2151  TonB-dependent receptor plug  23.25 
 
 		 790 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14868  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2108  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 790 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347716  normal  0.376393 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1759  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 790 aa  72.8  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.949304  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1678  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 790 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3287  TonB-dependent receptor plug  20.77 
 
 		 856 aa  55.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550182  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3810  TonB-dependent receptor plug  20.95 
 
 		 934 aa  52.8  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0593009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1947  hypothetical protein  20.56 
 
 		 859 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.205768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>