22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1947 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1947  hypothetical protein  100 
 
 		 859 aa  1779    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.205768  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0997  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 935 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3287  TonB-dependent receptor plug  28.06 
 
 		 856 aa  308  4.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550182  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2212  putative TonB dependent receptor  29.21 
 
 		 862 aa  304  5.000000000000001e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0760  TonB-dependent receptor plug  29.77 
 
 		 867 aa  303  9e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0846  TonB-dependent receptor, plug  28.23 
 
 		 879 aa  295  3e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0932  putative TonB dependent receptor  26.96 
 
 		 859 aa  295  4e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.175288  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1224  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 908 aa  276  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.735079  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2162  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 790 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2151  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 790 aa  244  5e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1685  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 790 aa  243  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2108  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 790 aa  243  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347716  normal  0.376393 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01466  hypothetical protein  27.92 
 
 		 790 aa  243  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01453  predicted porin protein  27.92 
 
 		 790 aa  243  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1678  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 790 aa  243  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1580  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 790 aa  241  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1759  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 790 aa  240  8e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.949304  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2599  TonB-dependent receptor plug  29.65 
 
 		 840 aa  237  7e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0447  TonB dependent receptor domain-containing protein  26.77 
 
 		 841 aa  228  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000427237  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3810  TonB-dependent receptor plug  21.37 
 
 		 934 aa  159  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0593009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0894  hypothetical protein  25.99 
 
 		 488 aa  128  4.0000000000000003e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0893  hypothetical protein  21.63 
 
 		 266 aa  50.4  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>