50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2212 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2212  putative TonB dependent receptor  100 
 
 		 862 aa  1785    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0932  putative TonB dependent receptor  51.61 
 
 		 859 aa  867    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.175288  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0997  TonB-dependent receptor plug  31.69 
 
 		 935 aa  385  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0760  TonB-dependent receptor plug  30.44 
 
 		 867 aa  349  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3287  TonB-dependent receptor plug  31.12 
 
 		 856 aa  349  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550182  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1947  hypothetical protein  29.18 
 
 		 859 aa  295  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.205768  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1759  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 790 aa  274  5.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.949304  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1685  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 790 aa  274  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2108  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 790 aa  272  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347716  normal  0.376393 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1678  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 790 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01453  predicted porin protein  28.82 
 
 		 790 aa  271  5e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01466  hypothetical protein  28.82 
 
 		 790 aa  271  5e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1580  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 790 aa  271  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2151  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 790 aa  268  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2162  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 790 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1224  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 908 aa  266  1e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.735079  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0846  TonB-dependent receptor, plug  27.37 
 
 		 879 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3810  TonB-dependent receptor plug  26.26 
 
 		 934 aa  229  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0593009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0447  TonB dependent receptor domain-containing protein  28.05 
 
 		 841 aa  207  9e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000427237  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2599  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 		 840 aa  200  7.999999999999999e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0894  hypothetical protein  26.58 
 
 		 488 aa  124  7e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0893  hypothetical protein  23.66 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1077 aa  58.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  27.42 
 
 		 1061 aa  54.7  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 1007 aa  53.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  22.99 
 
 		 992 aa  49.7  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  28.48 
 
 		 1056 aa  50.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  23.18 
 
 		 1010 aa  49.3  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  26.06 
 
 		 859 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1126 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  39.08 
 
 		 1071 aa  48.9  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3743  outer membrane receptor FepA  26.67 
 
 		 766 aa  48.1  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.325826  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  35.71 
 
 		 1066 aa  48.1  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1120 aa  47.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1122 aa  47.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1008 aa  47.4  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 618 aa  47  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 1105 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 1232 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 1008 aa  47  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 991 aa  45.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  29.08 
 
 		 1075 aa  45.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  27.71 
 
 		 623 aa  45.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  29.86 
 
 		 724 aa  44.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  29.86 
 
 		 724 aa  44.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  29.86 
 
 		 724 aa  44.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  29.86 
 
 		 724 aa  44.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  29.86 
 
 		 724 aa  44.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  26.95 
 
 		 1037 aa  44.3  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  24.15 
 
 		 746 aa  44.3  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>