14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0026 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0026  TonB-dependent receptor, putative  100 
 
 		 226 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.429014  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3539  TonB-like  61.47 
 
 		 251 aa  265  5e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.08035e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0204  TonB family protein  52.26 
 
 		 245 aa  228  8e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000615239  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3471  TonB family protein  49.01 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3324  TonB family protein  45.57 
 
 		 258 aa  174  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0714054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3581  TonB family protein  38.24 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3512  TonB family protein  42.55 
 
 		 258 aa  125  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00623688  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2976  putative TonB transport protein  25.55 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  26.25 
 
 		 451 aa  45.1  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2361  TonB family protein  28.44 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.264132 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0660  TonB-like protein  27.18 
 
 		 255 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1461  TonB-dependent receptor, putative  29.73 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0694  TonB family protein  26.42 
 
 		 256 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335594  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0695  TonB family protein  25.93 
 
 		 256 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.773203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>